Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ScaperF8VQ70 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ScaperF8VQ70 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
ScaperF8VQ70 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ScaperF8VQ70 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ScaperF8VQ70 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ScaperF8VQ70 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ScaperF8VQ70 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ScaperF8VQ70 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ScaperF8VQ70 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ScaperF8VQ70 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ScaperF8VQ70 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ScaperF8VQ70 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ScaperF8VQ70 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ScaperF8VQ70 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ScaperF8VQ70 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ScaperF8VQ70 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ScaperF8VQ70 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ScaperF8VQ70 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ScaperF8VQ70 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ScaperF8VQ70 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ScaperF8VQ70 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ScaperF8VQ70 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ScaperF8VQ70 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ScaperF8VQ70 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ScaperF8VQ70 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ScaperF8VQ70 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ScaperF8VQ70 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ScaperF8VQ70 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ScaperF8VQ70 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ScaperF8VQ70 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ScaperF8VQ70 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ScaperF8VQ70 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ScaperF8VQ70 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ScaperF8VQ70 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ScaperF8VQ70 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ScaperF8VQ70 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ScaperF8VQ70 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ScaperF8VQ70 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ScaperF8VQ70 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ScaperF8VQ70 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ScaperF8VQ70 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ScaperF8VQ70 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ScaperF8VQ70 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ScaperF8VQ70 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ScaperF8VQ70 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ScaperF8VQ70 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ScaperF8VQ70 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ScaperF8VQ70 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ScaperF8VQ70 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ScaperF8VQ70 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ScaperF8VQ70 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ScaperF8VQ70 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ScaperF8VQ70 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ScaperF8VQ70 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ScaperF8VQ70 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ScaperF8VQ70 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ScaperF8VQ70 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ScaperF8VQ70 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ScaperF8VQ70 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ScaperF8VQ70 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ScaperF8VQ70 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ScaperF8VQ70 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ScaperF8VQ70 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ScaperF8VQ70 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ScaperF8VQ70 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ScaperF8VQ70 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ScaperF8VQ70 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ScaperF8VQ70 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ScaperF8VQ70 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ScaperF8VQ70 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ScaperF8VQ70 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ScaperF8VQ70 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ScaperF8VQ70 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ScaperF8VQ70 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ScaperF8VQ70 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ScaperF8VQ70 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ScaperF8VQ70 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ScaperF8VQ70 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ScaperF8VQ70 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ScaperF8VQ70 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ScaperF8VQ70 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ScaperF8VQ70 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ScaperF8VQ70 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ScaperF8VQ70 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ScaperF8VQ70 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ScaperF8VQ70 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ScaperF8VQ70 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ScaperF8VQ70 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ScaperF8VQ70 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ScaperF8VQ70 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ScaperF8VQ70 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ScaperF8VQ70 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ScaperF8VQ70 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ScaperF8VQ70 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ScaperF8VQ70 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ScaperF8VQ70 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ScaperF8VQ70 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ScaperF8VQ70 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ScaperF8VQ70 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms