Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ5

Ercc6, Excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6F8VPZ5 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Ercc6F8VPZ5 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Ercc6F8VPZ5 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Ercc6F8VPZ5 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Ercc6F8VPZ5 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Ercc6F8VPZ5 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Ercc6F8VPZ5 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ercc6F8VPZ5 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ercc6F8VPZ5 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ercc6F8VPZ5 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ercc6F8VPZ5 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ercc6F8VPZ5 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ercc6F8VPZ5 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ercc6F8VPZ5 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ercc6F8VPZ5 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ercc6F8VPZ5 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ercc6F8VPZ5 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ercc6F8VPZ5 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ercc6F8VPZ5 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ercc6F8VPZ5 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
Ercc6F8VPZ5 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Ercc6F8VPZ5 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Ercc6F8VPZ5 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Ercc6F8VPZ5 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Ercc6F8VPZ5 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Ercc6F8VPZ5 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
Ercc6F8VPZ5 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Ercc6F8VPZ5 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Ercc6F8VPZ5 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ercc6F8VPZ5 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ercc6F8VPZ5 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ercc6F8VPZ5 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ercc6F8VPZ5 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ercc6F8VPZ5 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ercc6F8VPZ5 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ercc6F8VPZ5 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ercc6F8VPZ5 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ercc6F8VPZ5 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ercc6F8VPZ5 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ercc6F8VPZ5 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ercc6F8VPZ5 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Ercc6F8VPZ5 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
Ercc6F8VPZ5 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Ercc6F8VPZ5 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
Ercc6F8VPZ5 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Ercc6F8VPZ5 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Ercc6F8VPZ5 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Ercc6F8VPZ5 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Ercc6F8VPZ5 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Ercc6F8VPZ5 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
Ercc6F8VPZ5 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Ercc6F8VPZ5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Ercc6F8VPZ5 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
Ercc6F8VPZ5 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
Ercc6F8VPZ5 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Ercc6F8VPZ5 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Ercc6F8VPZ5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Ercc6F8VPZ5 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Ercc6F8VPZ5 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Ercc6F8VPZ5 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Ercc6F8VPZ5 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Ercc6F8VPZ5 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Ercc6F8VPZ5 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC30.01■■■□□ 2.4
Ercc6F8VPZ5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Ercc6F8VPZ5 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Ercc6F8VPZ5 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Ercc6F8VPZ5 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Ercc6F8VPZ5 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Ercc6F8VPZ5 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Ercc6F8VPZ5 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Ercc6F8VPZ5 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Ercc6F8VPZ5 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Ercc6F8VPZ5 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Ercc6F8VPZ5 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Ercc6F8VPZ5 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Ercc6F8VPZ5 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
Ercc6F8VPZ5 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Ercc6F8VPZ5 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC30■■■□□ 2.39
Ercc6F8VPZ5 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Ercc6F8VPZ5 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Ercc6F8VPZ5 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Ercc6F8VPZ5 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Ercc6F8VPZ5 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Ercc6F8VPZ5 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ercc6F8VPZ5 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ercc6F8VPZ5 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ercc6F8VPZ5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ercc6F8VPZ5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ercc6F8VPZ5 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ercc6F8VPZ5 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ercc6F8VPZ5 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ercc6F8VPZ5 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ercc6F8VPZ5 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ercc6F8VPZ5 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ercc6F8VPZ5 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ercc6F8VPZ5 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ercc6F8VPZ5 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ercc6F8VPZ5 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ercc6F8VPZ5 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ercc6F8VPZ5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms