Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp9yF8VPU6 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp9yF8VPU6 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp9yF8VPU6 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp9yF8VPU6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp9yF8VPU6 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp9yF8VPU6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp9yF8VPU6 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp9yF8VPU6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp9yF8VPU6 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp9yF8VPU6 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp9yF8VPU6 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp9yF8VPU6 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp9yF8VPU6 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp9yF8VPU6 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp9yF8VPU6 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp9yF8VPU6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp9yF8VPU6 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp9yF8VPU6 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp9yF8VPU6 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp9yF8VPU6 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp9yF8VPU6 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp9yF8VPU6 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp9yF8VPU6 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp9yF8VPU6 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp9yF8VPU6 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp9yF8VPU6 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp9yF8VPU6 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp9yF8VPU6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp9yF8VPU6 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp9yF8VPU6 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp9yF8VPU6 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp9yF8VPU6 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Usp9yF8VPU6 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Usp9yF8VPU6 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Usp9yF8VPU6 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Usp9yF8VPU6 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Usp9yF8VPU6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Usp9yF8VPU6 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Usp9yF8VPU6 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Usp9yF8VPU6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp9yF8VPU6 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp9yF8VPU6 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp9yF8VPU6 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp9yF8VPU6 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp9yF8VPU6 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp9yF8VPU6 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp9yF8VPU6 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp9yF8VPU6 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp9yF8VPU6 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp9yF8VPU6 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp9yF8VPU6 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp9yF8VPU6 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp9yF8VPU6 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp9yF8VPU6 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp9yF8VPU6 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp9yF8VPU6 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp9yF8VPU6 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp9yF8VPU6 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp9yF8VPU6 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp9yF8VPU6 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp9yF8VPU6 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp9yF8VPU6 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp9yF8VPU6 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp9yF8VPU6 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp9yF8VPU6 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp9yF8VPU6 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp9yF8VPU6 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp9yF8VPU6 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp9yF8VPU6 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp9yF8VPU6 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp9yF8VPU6 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp9yF8VPU6 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp9yF8VPU6 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp9yF8VPU6 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp9yF8VPU6 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp9yF8VPU6 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp9yF8VPU6 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp9yF8VPU6 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp9yF8VPU6 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp9yF8VPU6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp9yF8VPU6 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp9yF8VPU6 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp9yF8VPU6 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp9yF8VPU6 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp9yF8VPU6 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp9yF8VPU6 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp9yF8VPU6 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp9yF8VPU6 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp9yF8VPU6 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp9yF8VPU6 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp9yF8VPU6 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp9yF8VPU6 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp9yF8VPU6 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp9yF8VPU6 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp9yF8VPU6 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp9yF8VPU6 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp9yF8VPU6 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp9yF8VPU6 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp9yF8VPU6 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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