Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU2

Farp1, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp1F8VPU2 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Farp1F8VPU2 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Farp1F8VPU2 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Farp1F8VPU2 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Farp1F8VPU2 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Farp1F8VPU2 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Farp1F8VPU2 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Farp1F8VPU2 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Farp1F8VPU2 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Farp1F8VPU2 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Farp1F8VPU2 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Farp1F8VPU2 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Farp1F8VPU2 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Farp1F8VPU2 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Farp1F8VPU2 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Farp1F8VPU2 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Farp1F8VPU2 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Farp1F8VPU2 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Farp1F8VPU2 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Farp1F8VPU2 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Farp1F8VPU2 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Farp1F8VPU2 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Farp1F8VPU2 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Farp1F8VPU2 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Farp1F8VPU2 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Farp1F8VPU2 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Farp1F8VPU2 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Farp1F8VPU2 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Farp1F8VPU2 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Farp1F8VPU2 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Farp1F8VPU2 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Farp1F8VPU2 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Farp1F8VPU2 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Farp1F8VPU2 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Farp1F8VPU2 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Farp1F8VPU2 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Farp1F8VPU2 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Farp1F8VPU2 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Farp1F8VPU2 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Farp1F8VPU2 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Farp1F8VPU2 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Farp1F8VPU2 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Farp1F8VPU2 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Farp1F8VPU2 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Farp1F8VPU2 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Farp1F8VPU2 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Farp1F8VPU2 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Farp1F8VPU2 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Farp1F8VPU2 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Farp1F8VPU2 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Farp1F8VPU2 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Farp1F8VPU2 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Farp1F8VPU2 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Farp1F8VPU2 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Farp1F8VPU2 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Farp1F8VPU2 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Farp1F8VPU2 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Farp1F8VPU2 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Farp1F8VPU2 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Farp1F8VPU2 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Farp1F8VPU2 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Farp1F8VPU2 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Farp1F8VPU2 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Farp1F8VPU2 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Farp1F8VPU2 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Farp1F8VPU2 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Farp1F8VPU2 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Farp1F8VPU2 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Farp1F8VPU2 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Farp1F8VPU2 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Farp1F8VPU2 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Farp1F8VPU2 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Farp1F8VPU2 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Farp1F8VPU2 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Farp1F8VPU2 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Farp1F8VPU2 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Farp1F8VPU2 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Farp1F8VPU2 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Farp1F8VPU2 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Farp1F8VPU2 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Farp1F8VPU2 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Farp1F8VPU2 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Farp1F8VPU2 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Farp1F8VPU2 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Farp1F8VPU2 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Farp1F8VPU2 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Farp1F8VPU2 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Farp1F8VPU2 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Farp1F8VPU2 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Farp1F8VPU2 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Farp1F8VPU2 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Farp1F8VPU2 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Farp1F8VPU2 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Farp1F8VPU2 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Farp1F8VPU2 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Farp1F8VPU2 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Farp1F8VPU2 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Farp1F8VPU2 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Farp1F8VPU2 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Farp1F8VPU2 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms