Protein–RNA interactions for Protein: F8VPT3

Lct, Lactase, mousemouse

Predictions only

Length 1,931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LctF8VPT3 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LctF8VPT3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LctF8VPT3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LctF8VPT3 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LctF8VPT3 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
LctF8VPT3 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LctF8VPT3 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LctF8VPT3 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LctF8VPT3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LctF8VPT3 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LctF8VPT3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LctF8VPT3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LctF8VPT3 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LctF8VPT3 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LctF8VPT3 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LctF8VPT3 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
LctF8VPT3 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
LctF8VPT3 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
LctF8VPT3 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
LctF8VPT3 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
LctF8VPT3 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LctF8VPT3 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LctF8VPT3 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LctF8VPT3 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LctF8VPT3 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LctF8VPT3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LctF8VPT3 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LctF8VPT3 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LctF8VPT3 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LctF8VPT3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LctF8VPT3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LctF8VPT3 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LctF8VPT3 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LctF8VPT3 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LctF8VPT3 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LctF8VPT3 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LctF8VPT3 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LctF8VPT3 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LctF8VPT3 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LctF8VPT3 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LctF8VPT3 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
LctF8VPT3 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LctF8VPT3 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LctF8VPT3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LctF8VPT3 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LctF8VPT3 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
LctF8VPT3 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LctF8VPT3 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LctF8VPT3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LctF8VPT3 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LctF8VPT3 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LctF8VPT3 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LctF8VPT3 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LctF8VPT3 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LctF8VPT3 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LctF8VPT3 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LctF8VPT3 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LctF8VPT3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LctF8VPT3 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LctF8VPT3 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LctF8VPT3 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LctF8VPT3 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
LctF8VPT3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LctF8VPT3 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LctF8VPT3 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LctF8VPT3 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
LctF8VPT3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LctF8VPT3 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LctF8VPT3 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LctF8VPT3 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LctF8VPT3 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LctF8VPT3 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
LctF8VPT3 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LctF8VPT3 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
LctF8VPT3 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LctF8VPT3 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LctF8VPT3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LctF8VPT3 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LctF8VPT3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LctF8VPT3 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LctF8VPT3 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LctF8VPT3 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LctF8VPT3 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LctF8VPT3 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LctF8VPT3 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LctF8VPT3 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LctF8VPT3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LctF8VPT3 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LctF8VPT3 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LctF8VPT3 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LctF8VPT3 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LctF8VPT3 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LctF8VPT3 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LctF8VPT3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
LctF8VPT3 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
LctF8VPT3 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LctF8VPT3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LctF8VPT3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LctF8VPT3 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LctF8VPT3 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms