Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm28038F7BCN9 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm28038F7BCN9 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm28038F7BCN9 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm28038F7BCN9 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm28038F7BCN9 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm28038F7BCN9 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm28038F7BCN9 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm28038F7BCN9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm28038F7BCN9 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm28038F7BCN9 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm28038F7BCN9 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm28038F7BCN9 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm28038F7BCN9 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm28038F7BCN9 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm28038F7BCN9 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm28038F7BCN9 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm28038F7BCN9 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm28038F7BCN9 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm28038F7BCN9 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm28038F7BCN9 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm28038F7BCN9 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm28038F7BCN9 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm28038F7BCN9 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm28038F7BCN9 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm28038F7BCN9 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm28038F7BCN9 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm28038F7BCN9 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm28038F7BCN9 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm28038F7BCN9 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm28038F7BCN9 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm28038F7BCN9 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm28038F7BCN9 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm28038F7BCN9 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm28038F7BCN9 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm28038F7BCN9 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm28038F7BCN9 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm28038F7BCN9 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm28038F7BCN9 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm28038F7BCN9 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm28038F7BCN9 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
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Gm28038F7BCN9 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm28038F7BCN9 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm28038F7BCN9 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm28038F7BCN9 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm28038F7BCN9 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm28038F7BCN9 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm28038F7BCN9 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm28038F7BCN9 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm28038F7BCN9 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm28038F7BCN9 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm28038F7BCN9 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm28038F7BCN9 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm28038F7BCN9 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm28038F7BCN9 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm28038F7BCN9 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm28038F7BCN9 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm28038F7BCN9 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm28038F7BCN9 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Gm28038F7BCN9 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Gm28038F7BCN9 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Gm28038F7BCN9 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm28038F7BCN9 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm28038F7BCN9 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm28038F7BCN9 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Gm28038F7BCN9 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm28038F7BCN9 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm28038F7BCN9 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm28038F7BCN9 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm28038F7BCN9 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm28038F7BCN9 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm28038F7BCN9 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm28038F7BCN9 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm28038F7BCN9 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm28038F7BCN9 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm28038F7BCN9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm28038F7BCN9 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm28038F7BCN9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm28038F7BCN9 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm28038F7BCN9 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm28038F7BCN9 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm28038F7BCN9 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm28038F7BCN9 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm28038F7BCN9 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm28038F7BCN9 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm28038F7BCN9 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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