Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm28048F7BCN0 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm28048F7BCN0 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm28048F7BCN0 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm28048F7BCN0 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm28048F7BCN0 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm28048F7BCN0 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm28048F7BCN0 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm28048F7BCN0 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm28048F7BCN0 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm28048F7BCN0 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm28048F7BCN0 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm28048F7BCN0 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm28048F7BCN0 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm28048F7BCN0 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm28048F7BCN0 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm28048F7BCN0 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm28048F7BCN0 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm28048F7BCN0 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm28048F7BCN0 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm28048F7BCN0 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm28048F7BCN0 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm28048F7BCN0 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm28048F7BCN0 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm28048F7BCN0 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm28048F7BCN0 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm28048F7BCN0 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm28048F7BCN0 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm28048F7BCN0 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm28048F7BCN0 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm28048F7BCN0 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm28048F7BCN0 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm28048F7BCN0 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm28048F7BCN0 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm28048F7BCN0 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm28048F7BCN0 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm28048F7BCN0 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm28048F7BCN0 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm28048F7BCN0 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm28048F7BCN0 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm28048F7BCN0 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm28048F7BCN0 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm28048F7BCN0 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm28048F7BCN0 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm28048F7BCN0 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm28048F7BCN0 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm28048F7BCN0 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm28048F7BCN0 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm28048F7BCN0 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm28048F7BCN0 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm28048F7BCN0 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm28048F7BCN0 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm28048F7BCN0 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm28048F7BCN0 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm28048F7BCN0 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm28048F7BCN0 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm28048F7BCN0 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm28048F7BCN0 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm28048F7BCN0 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm28048F7BCN0 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm28048F7BCN0 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm28048F7BCN0 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm28048F7BCN0 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm28048F7BCN0 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm28048F7BCN0 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm28048F7BCN0 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm28048F7BCN0 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm28048F7BCN0 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm28048F7BCN0 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm28048F7BCN0 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm28048F7BCN0 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm28048F7BCN0 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm28048F7BCN0 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm28048F7BCN0 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm28048F7BCN0 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm28048F7BCN0 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm28048F7BCN0 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm28048F7BCN0 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm28048F7BCN0 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm28048F7BCN0 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm28048F7BCN0 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm28048F7BCN0 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm28048F7BCN0 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm28048F7BCN0 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm28048F7BCN0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm28048F7BCN0 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm28048F7BCN0 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm28048F7BCN0 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm28048F7BCN0 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm28048F7BCN0 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm28048F7BCN0 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm28048F7BCN0 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm28048F7BCN0 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm28048F7BCN0 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm28048F7BCN0 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm28048F7BCN0 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm28048F7BCN0 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm28048F7BCN0 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm28048F7BCN0 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm28048F7BCN0 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms