Protein–RNA interactions for Protein: F6ZIS7

Rarres1, Retinoic acid receptor responder (tazarotene-induced) 1, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rarres1F6ZIS7 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rarres1F6ZIS7 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rarres1F6ZIS7 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rarres1F6ZIS7 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rarres1F6ZIS7 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rarres1F6ZIS7 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rarres1F6ZIS7 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rarres1F6ZIS7 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rarres1F6ZIS7 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rarres1F6ZIS7 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rarres1F6ZIS7 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rarres1F6ZIS7 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rarres1F6ZIS7 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Rarres1F6ZIS7 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rarres1F6ZIS7 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rarres1F6ZIS7 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rarres1F6ZIS7 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rarres1F6ZIS7 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rarres1F6ZIS7 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rarres1F6ZIS7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rarres1F6ZIS7 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rarres1F6ZIS7 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rarres1F6ZIS7 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rarres1F6ZIS7 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rarres1F6ZIS7 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rarres1F6ZIS7 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rarres1F6ZIS7 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rarres1F6ZIS7 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rarres1F6ZIS7 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rarres1F6ZIS7 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rarres1F6ZIS7 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rarres1F6ZIS7 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rarres1F6ZIS7 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rarres1F6ZIS7 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rarres1F6ZIS7 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rarres1F6ZIS7 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rarres1F6ZIS7 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rarres1F6ZIS7 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rarres1F6ZIS7 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rarres1F6ZIS7 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rarres1F6ZIS7 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rarres1F6ZIS7 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rarres1F6ZIS7 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rarres1F6ZIS7 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rarres1F6ZIS7 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rarres1F6ZIS7 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rarres1F6ZIS7 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rarres1F6ZIS7 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rarres1F6ZIS7 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rarres1F6ZIS7 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rarres1F6ZIS7 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rarres1F6ZIS7 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rarres1F6ZIS7 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rarres1F6ZIS7 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rarres1F6ZIS7 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rarres1F6ZIS7 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rarres1F6ZIS7 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rarres1F6ZIS7 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rarres1F6ZIS7 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rarres1F6ZIS7 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rarres1F6ZIS7 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rarres1F6ZIS7 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Rarres1F6ZIS7 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rarres1F6ZIS7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rarres1F6ZIS7 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rarres1F6ZIS7 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rarres1F6ZIS7 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rarres1F6ZIS7 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rarres1F6ZIS7 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rarres1F6ZIS7 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rarres1F6ZIS7 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rarres1F6ZIS7 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rarres1F6ZIS7 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rarres1F6ZIS7 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rarres1F6ZIS7 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rarres1F6ZIS7 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rarres1F6ZIS7 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rarres1F6ZIS7 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rarres1F6ZIS7 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rarres1F6ZIS7 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rarres1F6ZIS7 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rarres1F6ZIS7 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rarres1F6ZIS7 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rarres1F6ZIS7 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rarres1F6ZIS7 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rarres1F6ZIS7 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Rarres1F6ZIS7 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rarres1F6ZIS7 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rarres1F6ZIS7 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rarres1F6ZIS7 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rarres1F6ZIS7 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rarres1F6ZIS7 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rarres1F6ZIS7 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rarres1F6ZIS7 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Rarres1F6ZIS7 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rarres1F6ZIS7 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rarres1F6ZIS7 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rarres1F6ZIS7 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rarres1F6ZIS7 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rarres1F6ZIS7 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms