Protein–RNA interactions for Protein: F6ZGR6

D430041D05Rik, RIKEN cDNA D430041D05 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D430041D05RikF6ZGR6 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
D430041D05RikF6ZGR6 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
D430041D05RikF6ZGR6 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
D430041D05RikF6ZGR6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
D430041D05RikF6ZGR6 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
D430041D05RikF6ZGR6 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
D430041D05RikF6ZGR6 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
D430041D05RikF6ZGR6 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
D430041D05RikF6ZGR6 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
D430041D05RikF6ZGR6 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
D430041D05RikF6ZGR6 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
D430041D05RikF6ZGR6 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
D430041D05RikF6ZGR6 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
D430041D05RikF6ZGR6 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
D430041D05RikF6ZGR6 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
D430041D05RikF6ZGR6 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
D430041D05RikF6ZGR6 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
D430041D05RikF6ZGR6 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
D430041D05RikF6ZGR6 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
D430041D05RikF6ZGR6 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
D430041D05RikF6ZGR6 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
D430041D05RikF6ZGR6 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
D430041D05RikF6ZGR6 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
D430041D05RikF6ZGR6 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
D430041D05RikF6ZGR6 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
D430041D05RikF6ZGR6 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
D430041D05RikF6ZGR6 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
D430041D05RikF6ZGR6 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
D430041D05RikF6ZGR6 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
D430041D05RikF6ZGR6 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
D430041D05RikF6ZGR6 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
D430041D05RikF6ZGR6 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
D430041D05RikF6ZGR6 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
D430041D05RikF6ZGR6 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
D430041D05RikF6ZGR6 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
D430041D05RikF6ZGR6 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
D430041D05RikF6ZGR6 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
D430041D05RikF6ZGR6 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
D430041D05RikF6ZGR6 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
D430041D05RikF6ZGR6 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
D430041D05RikF6ZGR6 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
D430041D05RikF6ZGR6 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
D430041D05RikF6ZGR6 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
D430041D05RikF6ZGR6 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
D430041D05RikF6ZGR6 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
D430041D05RikF6ZGR6 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
D430041D05RikF6ZGR6 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
D430041D05RikF6ZGR6 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
D430041D05RikF6ZGR6 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
D430041D05RikF6ZGR6 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
D430041D05RikF6ZGR6 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
D430041D05RikF6ZGR6 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
D430041D05RikF6ZGR6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
D430041D05RikF6ZGR6 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
D430041D05RikF6ZGR6 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
D430041D05RikF6ZGR6 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
D430041D05RikF6ZGR6 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
D430041D05RikF6ZGR6 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
D430041D05RikF6ZGR6 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
D430041D05RikF6ZGR6 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
D430041D05RikF6ZGR6 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
D430041D05RikF6ZGR6 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
D430041D05RikF6ZGR6 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
D430041D05RikF6ZGR6 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
D430041D05RikF6ZGR6 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
D430041D05RikF6ZGR6 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
D430041D05RikF6ZGR6 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
D430041D05RikF6ZGR6 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
D430041D05RikF6ZGR6 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
D430041D05RikF6ZGR6 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
D430041D05RikF6ZGR6 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
D430041D05RikF6ZGR6 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
D430041D05RikF6ZGR6 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
D430041D05RikF6ZGR6 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
D430041D05RikF6ZGR6 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
D430041D05RikF6ZGR6 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
D430041D05RikF6ZGR6 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
D430041D05RikF6ZGR6 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
D430041D05RikF6ZGR6 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
D430041D05RikF6ZGR6 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
D430041D05RikF6ZGR6 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
D430041D05RikF6ZGR6 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
D430041D05RikF6ZGR6 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
D430041D05RikF6ZGR6 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
D430041D05RikF6ZGR6 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
D430041D05RikF6ZGR6 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
D430041D05RikF6ZGR6 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
D430041D05RikF6ZGR6 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
D430041D05RikF6ZGR6 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
D430041D05RikF6ZGR6 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
D430041D05RikF6ZGR6 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
D430041D05RikF6ZGR6 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
D430041D05RikF6ZGR6 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
D430041D05RikF6ZGR6 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
D430041D05RikF6ZGR6 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
D430041D05RikF6ZGR6 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
D430041D05RikF6ZGR6 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
D430041D05RikF6ZGR6 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
D430041D05RikF6ZGR6 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
D430041D05RikF6ZGR6 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms