Protein–RNA interactions for Protein: F6XLV1

Crocc2, Ciliary rootlet coiled-coil, rootletin family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crocc2F6XLV1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Crocc2F6XLV1 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Crocc2F6XLV1 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Crocc2F6XLV1 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Crocc2F6XLV1 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Crocc2F6XLV1 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Crocc2F6XLV1 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Crocc2F6XLV1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Crocc2F6XLV1 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Crocc2F6XLV1 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Crocc2F6XLV1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Crocc2F6XLV1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Crocc2F6XLV1 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Crocc2F6XLV1 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Crocc2F6XLV1 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Crocc2F6XLV1 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Crocc2F6XLV1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Crocc2F6XLV1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Crocc2F6XLV1 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Crocc2F6XLV1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Crocc2F6XLV1 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Crocc2F6XLV1 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Crocc2F6XLV1 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Crocc2F6XLV1 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Crocc2F6XLV1 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Crocc2F6XLV1 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Crocc2F6XLV1 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Crocc2F6XLV1 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Crocc2F6XLV1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Crocc2F6XLV1 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Crocc2F6XLV1 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Crocc2F6XLV1 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Crocc2F6XLV1 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Crocc2F6XLV1 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Crocc2F6XLV1 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Crocc2F6XLV1 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Crocc2F6XLV1 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Crocc2F6XLV1 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Crocc2F6XLV1 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Crocc2F6XLV1 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Crocc2F6XLV1 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Crocc2F6XLV1 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Crocc2F6XLV1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Crocc2F6XLV1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Crocc2F6XLV1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Crocc2F6XLV1 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Crocc2F6XLV1 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Crocc2F6XLV1 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Crocc2F6XLV1 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Crocc2F6XLV1 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Crocc2F6XLV1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Crocc2F6XLV1 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Crocc2F6XLV1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Crocc2F6XLV1 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Crocc2F6XLV1 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Crocc2F6XLV1 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Crocc2F6XLV1 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Crocc2F6XLV1 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Crocc2F6XLV1 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Crocc2F6XLV1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Crocc2F6XLV1 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Crocc2F6XLV1 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Crocc2F6XLV1 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Crocc2F6XLV1 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Crocc2F6XLV1 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Crocc2F6XLV1 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Crocc2F6XLV1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Crocc2F6XLV1 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Crocc2F6XLV1 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Crocc2F6XLV1 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Crocc2F6XLV1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Crocc2F6XLV1 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Crocc2F6XLV1 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Crocc2F6XLV1 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Crocc2F6XLV1 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Crocc2F6XLV1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Crocc2F6XLV1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Crocc2F6XLV1 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Crocc2F6XLV1 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Crocc2F6XLV1 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Crocc2F6XLV1 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Crocc2F6XLV1 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Crocc2F6XLV1 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Crocc2F6XLV1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Crocc2F6XLV1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Crocc2F6XLV1 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Crocc2F6XLV1 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Crocc2F6XLV1 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Crocc2F6XLV1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Crocc2F6XLV1 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Crocc2F6XLV1 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Crocc2F6XLV1 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Crocc2F6XLV1 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Crocc2F6XLV1 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Crocc2F6XLV1 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Crocc2F6XLV1 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Crocc2F6XLV1 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Crocc2F6XLV1 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Crocc2F6XLV1 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Crocc2F6XLV1 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms