Protein–RNA interactions for Protein: F6VCN9

Gm5861, Predicted gene 5861 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5861F6VCN9 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm5861F6VCN9 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm5861F6VCN9 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm5861F6VCN9 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm5861F6VCN9 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm5861F6VCN9 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm5861F6VCN9 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm5861F6VCN9 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm5861F6VCN9 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm5861F6VCN9 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm5861F6VCN9 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm5861F6VCN9 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm5861F6VCN9 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm5861F6VCN9 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm5861F6VCN9 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm5861F6VCN9 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm5861F6VCN9 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm5861F6VCN9 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm5861F6VCN9 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm5861F6VCN9 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm5861F6VCN9 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm5861F6VCN9 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm5861F6VCN9 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm5861F6VCN9 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm5861F6VCN9 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm5861F6VCN9 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm5861F6VCN9 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm5861F6VCN9 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm5861F6VCN9 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm5861F6VCN9 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm5861F6VCN9 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm5861F6VCN9 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm5861F6VCN9 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm5861F6VCN9 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm5861F6VCN9 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm5861F6VCN9 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm5861F6VCN9 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm5861F6VCN9 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm5861F6VCN9 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm5861F6VCN9 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm5861F6VCN9 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm5861F6VCN9 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm5861F6VCN9 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm5861F6VCN9 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm5861F6VCN9 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm5861F6VCN9 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm5861F6VCN9 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm5861F6VCN9 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm5861F6VCN9 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm5861F6VCN9 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm5861F6VCN9 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm5861F6VCN9 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm5861F6VCN9 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm5861F6VCN9 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm5861F6VCN9 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Gm5861F6VCN9 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm5861F6VCN9 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm5861F6VCN9 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm5861F6VCN9 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm5861F6VCN9 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm5861F6VCN9 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm5861F6VCN9 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Gm5861F6VCN9 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm5861F6VCN9 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm5861F6VCN9 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Gm5861F6VCN9 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm5861F6VCN9 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm5861F6VCN9 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm5861F6VCN9 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm5861F6VCN9 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm5861F6VCN9 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm5861F6VCN9 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm5861F6VCN9 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm5861F6VCN9 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm5861F6VCN9 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm5861F6VCN9 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm5861F6VCN9 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm5861F6VCN9 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm5861F6VCN9 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm5861F6VCN9 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm5861F6VCN9 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm5861F6VCN9 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm5861F6VCN9 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm5861F6VCN9 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm5861F6VCN9 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm5861F6VCN9 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm5861F6VCN9 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm5861F6VCN9 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm5861F6VCN9 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm5861F6VCN9 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm5861F6VCN9 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm5861F6VCN9 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm5861F6VCN9 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm5861F6VCN9 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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