Protein–RNA interactions for Protein: F6V0H0

Pagr1b, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1B (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1bF6V0H0 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pagr1bF6V0H0 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pagr1bF6V0H0 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pagr1bF6V0H0 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pagr1bF6V0H0 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pagr1bF6V0H0 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pagr1bF6V0H0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pagr1bF6V0H0 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pagr1bF6V0H0 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pagr1bF6V0H0 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pagr1bF6V0H0 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pagr1bF6V0H0 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pagr1bF6V0H0 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pagr1bF6V0H0 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Pagr1bF6V0H0 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Pagr1bF6V0H0 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pagr1bF6V0H0 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pagr1bF6V0H0 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pagr1bF6V0H0 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Pagr1bF6V0H0 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pagr1bF6V0H0 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pagr1bF6V0H0 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pagr1bF6V0H0 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pagr1bF6V0H0 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pagr1bF6V0H0 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Pagr1bF6V0H0 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pagr1bF6V0H0 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pagr1bF6V0H0 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pagr1bF6V0H0 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pagr1bF6V0H0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pagr1bF6V0H0 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pagr1bF6V0H0 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pagr1bF6V0H0 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pagr1bF6V0H0 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pagr1bF6V0H0 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pagr1bF6V0H0 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Pagr1bF6V0H0 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pagr1bF6V0H0 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pagr1bF6V0H0 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pagr1bF6V0H0 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pagr1bF6V0H0 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pagr1bF6V0H0 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pagr1bF6V0H0 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pagr1bF6V0H0 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pagr1bF6V0H0 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Pagr1bF6V0H0 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pagr1bF6V0H0 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pagr1bF6V0H0 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pagr1bF6V0H0 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pagr1bF6V0H0 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pagr1bF6V0H0 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pagr1bF6V0H0 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pagr1bF6V0H0 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pagr1bF6V0H0 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pagr1bF6V0H0 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pagr1bF6V0H0 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Pagr1bF6V0H0 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pagr1bF6V0H0 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pagr1bF6V0H0 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pagr1bF6V0H0 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pagr1bF6V0H0 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pagr1bF6V0H0 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pagr1bF6V0H0 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Pagr1bF6V0H0 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pagr1bF6V0H0 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pagr1bF6V0H0 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pagr1bF6V0H0 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pagr1bF6V0H0 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pagr1bF6V0H0 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pagr1bF6V0H0 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pagr1bF6V0H0 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pagr1bF6V0H0 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pagr1bF6V0H0 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pagr1bF6V0H0 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pagr1bF6V0H0 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pagr1bF6V0H0 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pagr1bF6V0H0 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pagr1bF6V0H0 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pagr1bF6V0H0 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pagr1bF6V0H0 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pagr1bF6V0H0 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pagr1bF6V0H0 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pagr1bF6V0H0 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pagr1bF6V0H0 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pagr1bF6V0H0 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pagr1bF6V0H0 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pagr1bF6V0H0 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pagr1bF6V0H0 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pagr1bF6V0H0 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pagr1bF6V0H0 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Pagr1bF6V0H0 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Pagr1bF6V0H0 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pagr1bF6V0H0 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pagr1bF6V0H0 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pagr1bF6V0H0 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pagr1bF6V0H0 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pagr1bF6V0H0 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pagr1bF6V0H0 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pagr1bF6V0H0 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Pagr1bF6V0H0 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms