Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Syngap1F6SEU4 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Syngap1F6SEU4 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Syngap1F6SEU4 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Syngap1F6SEU4 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Syngap1F6SEU4 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Syngap1F6SEU4 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Syngap1F6SEU4 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Syngap1F6SEU4 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Syngap1F6SEU4 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Syngap1F6SEU4 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Syngap1F6SEU4 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Syngap1F6SEU4 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Syngap1F6SEU4 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Syngap1F6SEU4 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Syngap1F6SEU4 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Syngap1F6SEU4 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Syngap1F6SEU4 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Syngap1F6SEU4 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Syngap1F6SEU4 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Syngap1F6SEU4 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Syngap1F6SEU4 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Syngap1F6SEU4 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Syngap1F6SEU4 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Syngap1F6SEU4 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Syngap1F6SEU4 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Syngap1F6SEU4 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Syngap1F6SEU4 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Syngap1F6SEU4 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Syngap1F6SEU4 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Syngap1F6SEU4 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Syngap1F6SEU4 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Syngap1F6SEU4 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Syngap1F6SEU4 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Syngap1F6SEU4 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Syngap1F6SEU4 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Syngap1F6SEU4 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Syngap1F6SEU4 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Syngap1F6SEU4 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Syngap1F6SEU4 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Syngap1F6SEU4 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Syngap1F6SEU4 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Syngap1F6SEU4 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Syngap1F6SEU4 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Syngap1F6SEU4 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Syngap1F6SEU4 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Syngap1F6SEU4 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Syngap1F6SEU4 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Syngap1F6SEU4 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Syngap1F6SEU4 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Syngap1F6SEU4 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Syngap1F6SEU4 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Syngap1F6SEU4 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Syngap1F6SEU4 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Syngap1F6SEU4 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Syngap1F6SEU4 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Syngap1F6SEU4 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Syngap1F6SEU4 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Syngap1F6SEU4 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Syngap1F6SEU4 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Syngap1F6SEU4 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Syngap1F6SEU4 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Syngap1F6SEU4 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Syngap1F6SEU4 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Syngap1F6SEU4 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Syngap1F6SEU4 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Syngap1F6SEU4 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Syngap1F6SEU4 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Syngap1F6SEU4 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Syngap1F6SEU4 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Syngap1F6SEU4 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Syngap1F6SEU4 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Syngap1F6SEU4 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Syngap1F6SEU4 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Syngap1F6SEU4 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Syngap1F6SEU4 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Syngap1F6SEU4 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Syngap1F6SEU4 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Syngap1F6SEU4 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Syngap1F6SEU4 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Syngap1F6SEU4 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Syngap1F6SEU4 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Syngap1F6SEU4 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Syngap1F6SEU4 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Syngap1F6SEU4 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Syngap1F6SEU4 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Syngap1F6SEU4 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Syngap1F6SEU4 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Syngap1F6SEU4 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Syngap1F6SEU4 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Syngap1F6SEU4 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Syngap1F6SEU4 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Syngap1F6SEU4 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Syngap1F6SEU4 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Syngap1F6SEU4 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Syngap1F6SEU4 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Syngap1F6SEU4 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Syngap1F6SEU4 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Syngap1F6SEU4 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Syngap1F6SEU4 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms