Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Y3

Ccdc7b, Coiled-coil domain-containing 7B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc7bE9Q9Y3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms