Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9R3

4930451I11Rik, RIKEN cDNA 4930451I11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930451I11RikE9Q9R3 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
4930451I11RikE9Q9R3 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930451I11RikE9Q9R3 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930451I11RikE9Q9R3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930451I11RikE9Q9R3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930451I11RikE9Q9R3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930451I11RikE9Q9R3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930451I11RikE9Q9R3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930451I11RikE9Q9R3 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930451I11RikE9Q9R3 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930451I11RikE9Q9R3 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930451I11RikE9Q9R3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930451I11RikE9Q9R3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930451I11RikE9Q9R3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930451I11RikE9Q9R3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930451I11RikE9Q9R3 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930451I11RikE9Q9R3 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930451I11RikE9Q9R3 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930451I11RikE9Q9R3 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
4930451I11RikE9Q9R3 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930451I11RikE9Q9R3 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930451I11RikE9Q9R3 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
4930451I11RikE9Q9R3 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930451I11RikE9Q9R3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930451I11RikE9Q9R3 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930451I11RikE9Q9R3 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930451I11RikE9Q9R3 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930451I11RikE9Q9R3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930451I11RikE9Q9R3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930451I11RikE9Q9R3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930451I11RikE9Q9R3 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930451I11RikE9Q9R3 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
4930451I11RikE9Q9R3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930451I11RikE9Q9R3 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930451I11RikE9Q9R3 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
4930451I11RikE9Q9R3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
4930451I11RikE9Q9R3 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
4930451I11RikE9Q9R3 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
4930451I11RikE9Q9R3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
4930451I11RikE9Q9R3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
4930451I11RikE9Q9R3 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
4930451I11RikE9Q9R3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930451I11RikE9Q9R3 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930451I11RikE9Q9R3 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930451I11RikE9Q9R3 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
4930451I11RikE9Q9R3 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
4930451I11RikE9Q9R3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930451I11RikE9Q9R3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930451I11RikE9Q9R3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930451I11RikE9Q9R3 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930451I11RikE9Q9R3 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930451I11RikE9Q9R3 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930451I11RikE9Q9R3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930451I11RikE9Q9R3 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930451I11RikE9Q9R3 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930451I11RikE9Q9R3 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930451I11RikE9Q9R3 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930451I11RikE9Q9R3 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930451I11RikE9Q9R3 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930451I11RikE9Q9R3 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930451I11RikE9Q9R3 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930451I11RikE9Q9R3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930451I11RikE9Q9R3 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930451I11RikE9Q9R3 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930451I11RikE9Q9R3 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930451I11RikE9Q9R3 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
4930451I11RikE9Q9R3 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930451I11RikE9Q9R3 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930451I11RikE9Q9R3 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930451I11RikE9Q9R3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930451I11RikE9Q9R3 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930451I11RikE9Q9R3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930451I11RikE9Q9R3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930451I11RikE9Q9R3 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
4930451I11RikE9Q9R3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930451I11RikE9Q9R3 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
4930451I11RikE9Q9R3 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930451I11RikE9Q9R3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930451I11RikE9Q9R3 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930451I11RikE9Q9R3 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930451I11RikE9Q9R3 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930451I11RikE9Q9R3 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
4930451I11RikE9Q9R3 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
4930451I11RikE9Q9R3 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930451I11RikE9Q9R3 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
4930451I11RikE9Q9R3 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
4930451I11RikE9Q9R3 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930451I11RikE9Q9R3 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930451I11RikE9Q9R3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930451I11RikE9Q9R3 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930451I11RikE9Q9R3 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930451I11RikE9Q9R3 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930451I11RikE9Q9R3 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930451I11RikE9Q9R3 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930451I11RikE9Q9R3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930451I11RikE9Q9R3 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930451I11RikE9Q9R3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930451I11RikE9Q9R3 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930451I11RikE9Q9R3 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930451I11RikE9Q9R3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms