Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9N3

Vmn1r152, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r152E9Q9N3 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r152E9Q9N3 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r152E9Q9N3 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r152E9Q9N3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r152E9Q9N3 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r152E9Q9N3 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r152E9Q9N3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r152E9Q9N3 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r152E9Q9N3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r152E9Q9N3 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r152E9Q9N3 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r152E9Q9N3 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r152E9Q9N3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r152E9Q9N3 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r152E9Q9N3 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r152E9Q9N3 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r152E9Q9N3 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r152E9Q9N3 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r152E9Q9N3 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r152E9Q9N3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r152E9Q9N3 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r152E9Q9N3 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r152E9Q9N3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r152E9Q9N3 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r152E9Q9N3 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r152E9Q9N3 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r152E9Q9N3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r152E9Q9N3 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r152E9Q9N3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r152E9Q9N3 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r152E9Q9N3 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r152E9Q9N3 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r152E9Q9N3 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r152E9Q9N3 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r152E9Q9N3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r152E9Q9N3 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r152E9Q9N3 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r152E9Q9N3 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r152E9Q9N3 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r152E9Q9N3 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r152E9Q9N3 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r152E9Q9N3 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r152E9Q9N3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r152E9Q9N3 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r152E9Q9N3 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r152E9Q9N3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r152E9Q9N3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r152E9Q9N3 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r152E9Q9N3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r152E9Q9N3 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r152E9Q9N3 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r152E9Q9N3 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r152E9Q9N3 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r152E9Q9N3 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r152E9Q9N3 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r152E9Q9N3 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r152E9Q9N3 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r152E9Q9N3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r152E9Q9N3 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r152E9Q9N3 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r152E9Q9N3 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r152E9Q9N3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r152E9Q9N3 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r152E9Q9N3 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r152E9Q9N3 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r152E9Q9N3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r152E9Q9N3 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r152E9Q9N3 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r152E9Q9N3 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r152E9Q9N3 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r152E9Q9N3 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r152E9Q9N3 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r152E9Q9N3 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r152E9Q9N3 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r152E9Q9N3 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r152E9Q9N3 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r152E9Q9N3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r152E9Q9N3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r152E9Q9N3 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r152E9Q9N3 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r152E9Q9N3 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r152E9Q9N3 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r152E9Q9N3 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r152E9Q9N3 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r152E9Q9N3 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r152E9Q9N3 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r152E9Q9N3 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r152E9Q9N3 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r152E9Q9N3 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r152E9Q9N3 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r152E9Q9N3 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r152E9Q9N3 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r152E9Q9N3 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r152E9Q9N3 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r152E9Q9N3 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r152E9Q9N3 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r152E9Q9N3 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r152E9Q9N3 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r152E9Q9N3 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r152E9Q9N3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms