Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7Q1

Gm5407, Predicted gene 5407, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5407E9Q7Q1 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm5407E9Q7Q1 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm5407E9Q7Q1 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm5407E9Q7Q1 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm5407E9Q7Q1 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5407E9Q7Q1 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5407E9Q7Q1 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5407E9Q7Q1 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5407E9Q7Q1 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5407E9Q7Q1 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5407E9Q7Q1 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5407E9Q7Q1 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5407E9Q7Q1 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5407E9Q7Q1 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5407E9Q7Q1 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5407E9Q7Q1 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5407E9Q7Q1 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5407E9Q7Q1 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5407E9Q7Q1 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5407E9Q7Q1 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5407E9Q7Q1 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5407E9Q7Q1 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5407E9Q7Q1 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5407E9Q7Q1 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5407E9Q7Q1 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5407E9Q7Q1 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5407E9Q7Q1 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5407E9Q7Q1 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5407E9Q7Q1 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5407E9Q7Q1 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5407E9Q7Q1 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5407E9Q7Q1 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5407E9Q7Q1 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5407E9Q7Q1 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5407E9Q7Q1 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5407E9Q7Q1 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5407E9Q7Q1 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5407E9Q7Q1 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5407E9Q7Q1 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5407E9Q7Q1 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5407E9Q7Q1 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5407E9Q7Q1 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5407E9Q7Q1 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5407E9Q7Q1 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5407E9Q7Q1 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5407E9Q7Q1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5407E9Q7Q1 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5407E9Q7Q1 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5407E9Q7Q1 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5407E9Q7Q1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5407E9Q7Q1 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5407E9Q7Q1 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5407E9Q7Q1 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5407E9Q7Q1 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5407E9Q7Q1 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5407E9Q7Q1 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5407E9Q7Q1 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5407E9Q7Q1 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5407E9Q7Q1 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5407E9Q7Q1 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5407E9Q7Q1 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5407E9Q7Q1 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5407E9Q7Q1 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5407E9Q7Q1 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5407E9Q7Q1 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5407E9Q7Q1 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5407E9Q7Q1 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5407E9Q7Q1 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5407E9Q7Q1 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5407E9Q7Q1 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5407E9Q7Q1 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5407E9Q7Q1 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5407E9Q7Q1 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5407E9Q7Q1 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5407E9Q7Q1 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5407E9Q7Q1 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5407E9Q7Q1 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5407E9Q7Q1 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5407E9Q7Q1 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5407E9Q7Q1 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5407E9Q7Q1 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5407E9Q7Q1 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5407E9Q7Q1 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5407E9Q7Q1 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5407E9Q7Q1 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5407E9Q7Q1 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5407E9Q7Q1 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5407E9Q7Q1 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5407E9Q7Q1 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5407E9Q7Q1 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5407E9Q7Q1 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5407E9Q7Q1 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5407E9Q7Q1 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5407E9Q7Q1 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5407E9Q7Q1 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5407E9Q7Q1 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5407E9Q7Q1 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5407E9Q7Q1 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5407E9Q7Q1 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5407E9Q7Q1 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms