Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7P9

Cdhr2, Cadherin-related family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdhr2E9Q7P9 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdhr2E9Q7P9 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdhr2E9Q7P9 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdhr2E9Q7P9 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdhr2E9Q7P9 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdhr2E9Q7P9 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdhr2E9Q7P9 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdhr2E9Q7P9 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdhr2E9Q7P9 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdhr2E9Q7P9 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdhr2E9Q7P9 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdhr2E9Q7P9 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdhr2E9Q7P9 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdhr2E9Q7P9 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdhr2E9Q7P9 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdhr2E9Q7P9 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdhr2E9Q7P9 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdhr2E9Q7P9 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdhr2E9Q7P9 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdhr2E9Q7P9 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdhr2E9Q7P9 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdhr2E9Q7P9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdhr2E9Q7P9 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdhr2E9Q7P9 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdhr2E9Q7P9 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdhr2E9Q7P9 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdhr2E9Q7P9 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdhr2E9Q7P9 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdhr2E9Q7P9 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdhr2E9Q7P9 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdhr2E9Q7P9 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdhr2E9Q7P9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdhr2E9Q7P9 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdhr2E9Q7P9 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdhr2E9Q7P9 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdhr2E9Q7P9 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdhr2E9Q7P9 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdhr2E9Q7P9 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdhr2E9Q7P9 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdhr2E9Q7P9 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdhr2E9Q7P9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdhr2E9Q7P9 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdhr2E9Q7P9 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdhr2E9Q7P9 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdhr2E9Q7P9 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdhr2E9Q7P9 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdhr2E9Q7P9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdhr2E9Q7P9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdhr2E9Q7P9 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdhr2E9Q7P9 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdhr2E9Q7P9 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdhr2E9Q7P9 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdhr2E9Q7P9 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdhr2E9Q7P9 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdhr2E9Q7P9 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdhr2E9Q7P9 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdhr2E9Q7P9 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdhr2E9Q7P9 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdhr2E9Q7P9 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdhr2E9Q7P9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdhr2E9Q7P9 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdhr2E9Q7P9 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdhr2E9Q7P9 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdhr2E9Q7P9 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdhr2E9Q7P9 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdhr2E9Q7P9 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdhr2E9Q7P9 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdhr2E9Q7P9 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdhr2E9Q7P9 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdhr2E9Q7P9 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdhr2E9Q7P9 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdhr2E9Q7P9 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdhr2E9Q7P9 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdhr2E9Q7P9 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdhr2E9Q7P9 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdhr2E9Q7P9 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdhr2E9Q7P9 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdhr2E9Q7P9 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdhr2E9Q7P9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdhr2E9Q7P9 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdhr2E9Q7P9 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdhr2E9Q7P9 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdhr2E9Q7P9 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdhr2E9Q7P9 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdhr2E9Q7P9 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdhr2E9Q7P9 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdhr2E9Q7P9 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdhr2E9Q7P9 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdhr2E9Q7P9 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdhr2E9Q7P9 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdhr2E9Q7P9 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdhr2E9Q7P9 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdhr2E9Q7P9 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdhr2E9Q7P9 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdhr2E9Q7P9 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdhr2E9Q7P9 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdhr2E9Q7P9 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdhr2E9Q7P9 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdhr2E9Q7P9 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdhr2E9Q7P9 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.5 ms