Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7P1

Col22a1, Collagen, type XXII, alpha 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col22a1E9Q7P1 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Col22a1E9Q7P1 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Col22a1E9Q7P1 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Col22a1E9Q7P1 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Col22a1E9Q7P1 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Col22a1E9Q7P1 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col22a1E9Q7P1 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col22a1E9Q7P1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col22a1E9Q7P1 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col22a1E9Q7P1 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col22a1E9Q7P1 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col22a1E9Q7P1 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col22a1E9Q7P1 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col22a1E9Q7P1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col22a1E9Q7P1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col22a1E9Q7P1 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col22a1E9Q7P1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col22a1E9Q7P1 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col22a1E9Q7P1 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col22a1E9Q7P1 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col22a1E9Q7P1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col22a1E9Q7P1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col22a1E9Q7P1 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col22a1E9Q7P1 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col22a1E9Q7P1 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Col22a1E9Q7P1 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col22a1E9Q7P1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Col22a1E9Q7P1 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col22a1E9Q7P1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col22a1E9Q7P1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col22a1E9Q7P1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col22a1E9Q7P1 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Col22a1E9Q7P1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col22a1E9Q7P1 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col22a1E9Q7P1 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col22a1E9Q7P1 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Col22a1E9Q7P1 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col22a1E9Q7P1 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Col22a1E9Q7P1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col22a1E9Q7P1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col22a1E9Q7P1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col22a1E9Q7P1 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col22a1E9Q7P1 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col22a1E9Q7P1 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Col22a1E9Q7P1 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col22a1E9Q7P1 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col22a1E9Q7P1 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col22a1E9Q7P1 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col22a1E9Q7P1 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
Col22a1E9Q7P1 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Col22a1E9Q7P1 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Col22a1E9Q7P1 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Col22a1E9Q7P1 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Col22a1E9Q7P1 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Col22a1E9Q7P1 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Col22a1E9Q7P1 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Col22a1E9Q7P1 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Col22a1E9Q7P1 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Col22a1E9Q7P1 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Col22a1E9Q7P1 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Col22a1E9Q7P1 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Col22a1E9Q7P1 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Col22a1E9Q7P1 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Col22a1E9Q7P1 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Col22a1E9Q7P1 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Col22a1E9Q7P1 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Col22a1E9Q7P1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Col22a1E9Q7P1 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Col22a1E9Q7P1 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col22a1E9Q7P1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col22a1E9Q7P1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col22a1E9Q7P1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col22a1E9Q7P1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col22a1E9Q7P1 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col22a1E9Q7P1 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col22a1E9Q7P1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col22a1E9Q7P1 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col22a1E9Q7P1 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col22a1E9Q7P1 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col22a1E9Q7P1 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col22a1E9Q7P1 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col22a1E9Q7P1 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col22a1E9Q7P1 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col22a1E9Q7P1 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col22a1E9Q7P1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col22a1E9Q7P1 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col22a1E9Q7P1 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col22a1E9Q7P1 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Col22a1E9Q7P1 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Col22a1E9Q7P1 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col22a1E9Q7P1 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col22a1E9Q7P1 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col22a1E9Q7P1 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col22a1E9Q7P1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col22a1E9Q7P1 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col22a1E9Q7P1 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col22a1E9Q7P1 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col22a1E9Q7P1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col22a1E9Q7P1 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col22a1E9Q7P1 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms