Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6E9

Simc1, SUMO-interacting motifs-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Simc1E9Q6E9 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Simc1E9Q6E9 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Simc1E9Q6E9 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Simc1E9Q6E9 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Simc1E9Q6E9 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Simc1E9Q6E9 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Simc1E9Q6E9 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Simc1E9Q6E9 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Simc1E9Q6E9 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Simc1E9Q6E9 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Simc1E9Q6E9 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Simc1E9Q6E9 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Simc1E9Q6E9 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Simc1E9Q6E9 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Simc1E9Q6E9 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Simc1E9Q6E9 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Simc1E9Q6E9 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Simc1E9Q6E9 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Simc1E9Q6E9 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Simc1E9Q6E9 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Simc1E9Q6E9 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Simc1E9Q6E9 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Simc1E9Q6E9 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Simc1E9Q6E9 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Simc1E9Q6E9 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Simc1E9Q6E9 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Simc1E9Q6E9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Simc1E9Q6E9 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Simc1E9Q6E9 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Simc1E9Q6E9 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Simc1E9Q6E9 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Simc1E9Q6E9 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Simc1E9Q6E9 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Simc1E9Q6E9 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Simc1E9Q6E9 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Simc1E9Q6E9 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Simc1E9Q6E9 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Simc1E9Q6E9 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Simc1E9Q6E9 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Simc1E9Q6E9 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Simc1E9Q6E9 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Simc1E9Q6E9 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Simc1E9Q6E9 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Simc1E9Q6E9 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Simc1E9Q6E9 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Simc1E9Q6E9 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Simc1E9Q6E9 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Simc1E9Q6E9 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Simc1E9Q6E9 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Simc1E9Q6E9 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Simc1E9Q6E9 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Simc1E9Q6E9 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Simc1E9Q6E9 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Simc1E9Q6E9 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Simc1E9Q6E9 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Simc1E9Q6E9 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Simc1E9Q6E9 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Simc1E9Q6E9 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Simc1E9Q6E9 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Simc1E9Q6E9 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Simc1E9Q6E9 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Simc1E9Q6E9 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Simc1E9Q6E9 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Simc1E9Q6E9 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Simc1E9Q6E9 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Simc1E9Q6E9 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Simc1E9Q6E9 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Simc1E9Q6E9 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Simc1E9Q6E9 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Simc1E9Q6E9 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Simc1E9Q6E9 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Simc1E9Q6E9 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Simc1E9Q6E9 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Simc1E9Q6E9 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Simc1E9Q6E9 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Simc1E9Q6E9 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Simc1E9Q6E9 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Simc1E9Q6E9 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Simc1E9Q6E9 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Simc1E9Q6E9 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Simc1E9Q6E9 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Simc1E9Q6E9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Simc1E9Q6E9 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Simc1E9Q6E9 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Simc1E9Q6E9 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Simc1E9Q6E9 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Simc1E9Q6E9 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Simc1E9Q6E9 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Simc1E9Q6E9 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Simc1E9Q6E9 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Simc1E9Q6E9 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Simc1E9Q6E9 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Simc1E9Q6E9 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Simc1E9Q6E9 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Simc1E9Q6E9 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Simc1E9Q6E9 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Simc1E9Q6E9 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Simc1E9Q6E9 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Simc1E9Q6E9 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Simc1E9Q6E9 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms