Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5Z5

Fancf, Fanconi anemia group F protein, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FancfE9Q5Z5 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FancfE9Q5Z5 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FancfE9Q5Z5 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FancfE9Q5Z5 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FancfE9Q5Z5 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FancfE9Q5Z5 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
FancfE9Q5Z5 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
FancfE9Q5Z5 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FancfE9Q5Z5 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FancfE9Q5Z5 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FancfE9Q5Z5 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FancfE9Q5Z5 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FancfE9Q5Z5 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FancfE9Q5Z5 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FancfE9Q5Z5 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FancfE9Q5Z5 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FancfE9Q5Z5 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FancfE9Q5Z5 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FancfE9Q5Z5 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FancfE9Q5Z5 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FancfE9Q5Z5 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FancfE9Q5Z5 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FancfE9Q5Z5 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FancfE9Q5Z5 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
FancfE9Q5Z5 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FancfE9Q5Z5 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FancfE9Q5Z5 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FancfE9Q5Z5 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FancfE9Q5Z5 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FancfE9Q5Z5 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FancfE9Q5Z5 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FancfE9Q5Z5 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FancfE9Q5Z5 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FancfE9Q5Z5 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FancfE9Q5Z5 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FancfE9Q5Z5 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FancfE9Q5Z5 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FancfE9Q5Z5 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FancfE9Q5Z5 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FancfE9Q5Z5 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FancfE9Q5Z5 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FancfE9Q5Z5 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FancfE9Q5Z5 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FancfE9Q5Z5 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FancfE9Q5Z5 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FancfE9Q5Z5 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FancfE9Q5Z5 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FancfE9Q5Z5 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FancfE9Q5Z5 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FancfE9Q5Z5 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FancfE9Q5Z5 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FancfE9Q5Z5 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FancfE9Q5Z5 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FancfE9Q5Z5 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FancfE9Q5Z5 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
FancfE9Q5Z5 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FancfE9Q5Z5 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FancfE9Q5Z5 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FancfE9Q5Z5 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FancfE9Q5Z5 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FancfE9Q5Z5 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FancfE9Q5Z5 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FancfE9Q5Z5 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FancfE9Q5Z5 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
FancfE9Q5Z5 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FancfE9Q5Z5 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FancfE9Q5Z5 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FancfE9Q5Z5 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FancfE9Q5Z5 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FancfE9Q5Z5 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FancfE9Q5Z5 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FancfE9Q5Z5 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FancfE9Q5Z5 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FancfE9Q5Z5 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FancfE9Q5Z5 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FancfE9Q5Z5 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FancfE9Q5Z5 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FancfE9Q5Z5 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FancfE9Q5Z5 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FancfE9Q5Z5 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FancfE9Q5Z5 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FancfE9Q5Z5 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FancfE9Q5Z5 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FancfE9Q5Z5 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FancfE9Q5Z5 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FancfE9Q5Z5 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FancfE9Q5Z5 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
FancfE9Q5Z5 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FancfE9Q5Z5 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FancfE9Q5Z5 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FancfE9Q5Z5 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FancfE9Q5Z5 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FancfE9Q5Z5 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FancfE9Q5Z5 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FancfE9Q5Z5 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FancfE9Q5Z5 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FancfE9Q5Z5 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FancfE9Q5Z5 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FancfE9Q5Z5 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FancfE9Q5Z5 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms