Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5K2

Gm17728, Predicted gene, 17728, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17728E9Q5K2 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm17728E9Q5K2 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm17728E9Q5K2 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm17728E9Q5K2 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm17728E9Q5K2 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm17728E9Q5K2 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm17728E9Q5K2 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm17728E9Q5K2 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm17728E9Q5K2 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm17728E9Q5K2 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm17728E9Q5K2 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm17728E9Q5K2 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm17728E9Q5K2 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm17728E9Q5K2 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm17728E9Q5K2 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm17728E9Q5K2 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm17728E9Q5K2 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm17728E9Q5K2 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm17728E9Q5K2 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm17728E9Q5K2 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm17728E9Q5K2 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm17728E9Q5K2 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm17728E9Q5K2 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm17728E9Q5K2 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm17728E9Q5K2 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm17728E9Q5K2 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm17728E9Q5K2 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm17728E9Q5K2 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm17728E9Q5K2 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm17728E9Q5K2 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm17728E9Q5K2 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm17728E9Q5K2 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm17728E9Q5K2 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm17728E9Q5K2 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm17728E9Q5K2 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm17728E9Q5K2 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm17728E9Q5K2 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm17728E9Q5K2 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm17728E9Q5K2 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm17728E9Q5K2 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm17728E9Q5K2 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm17728E9Q5K2 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm17728E9Q5K2 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm17728E9Q5K2 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm17728E9Q5K2 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm17728E9Q5K2 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm17728E9Q5K2 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm17728E9Q5K2 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm17728E9Q5K2 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm17728E9Q5K2 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm17728E9Q5K2 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm17728E9Q5K2 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm17728E9Q5K2 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm17728E9Q5K2 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm17728E9Q5K2 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm17728E9Q5K2 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm17728E9Q5K2 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm17728E9Q5K2 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17728E9Q5K2 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17728E9Q5K2 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17728E9Q5K2 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17728E9Q5K2 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17728E9Q5K2 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17728E9Q5K2 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17728E9Q5K2 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17728E9Q5K2 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17728E9Q5K2 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17728E9Q5K2 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17728E9Q5K2 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17728E9Q5K2 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17728E9Q5K2 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm17728E9Q5K2 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm17728E9Q5K2 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm17728E9Q5K2 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm17728E9Q5K2 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm17728E9Q5K2 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm17728E9Q5K2 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm17728E9Q5K2 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm17728E9Q5K2 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm17728E9Q5K2 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm17728E9Q5K2 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm17728E9Q5K2 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm17728E9Q5K2 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm17728E9Q5K2 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm17728E9Q5K2 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm17728E9Q5K2 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm17728E9Q5K2 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm17728E9Q5K2 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm17728E9Q5K2 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm17728E9Q5K2 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm17728E9Q5K2 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm17728E9Q5K2 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm17728E9Q5K2 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm17728E9Q5K2 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm17728E9Q5K2 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm17728E9Q5K2 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm17728E9Q5K2 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm17728E9Q5K2 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm17728E9Q5K2 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm17728E9Q5K2 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms