Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5C9

Nolc1, Nucleolar and coiled-body phosphoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 702 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nolc1E9Q5C9 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nolc1E9Q5C9 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nolc1E9Q5C9 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nolc1E9Q5C9 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nolc1E9Q5C9 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nolc1E9Q5C9 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nolc1E9Q5C9 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nolc1E9Q5C9 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nolc1E9Q5C9 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nolc1E9Q5C9 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nolc1E9Q5C9 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nolc1E9Q5C9 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nolc1E9Q5C9 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nolc1E9Q5C9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nolc1E9Q5C9 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nolc1E9Q5C9 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nolc1E9Q5C9 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nolc1E9Q5C9 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nolc1E9Q5C9 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nolc1E9Q5C9 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nolc1E9Q5C9 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nolc1E9Q5C9 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nolc1E9Q5C9 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nolc1E9Q5C9 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nolc1E9Q5C9 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nolc1E9Q5C9 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Nolc1E9Q5C9 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nolc1E9Q5C9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nolc1E9Q5C9 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nolc1E9Q5C9 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nolc1E9Q5C9 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nolc1E9Q5C9 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nolc1E9Q5C9 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nolc1E9Q5C9 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nolc1E9Q5C9 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nolc1E9Q5C9 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nolc1E9Q5C9 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nolc1E9Q5C9 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nolc1E9Q5C9 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nolc1E9Q5C9 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nolc1E9Q5C9 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nolc1E9Q5C9 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nolc1E9Q5C9 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nolc1E9Q5C9 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nolc1E9Q5C9 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nolc1E9Q5C9 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nolc1E9Q5C9 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Nolc1E9Q5C9 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nolc1E9Q5C9 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nolc1E9Q5C9 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nolc1E9Q5C9 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nolc1E9Q5C9 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nolc1E9Q5C9 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Nolc1E9Q5C9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nolc1E9Q5C9 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nolc1E9Q5C9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Nolc1E9Q5C9 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nolc1E9Q5C9 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nolc1E9Q5C9 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nolc1E9Q5C9 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nolc1E9Q5C9 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nolc1E9Q5C9 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nolc1E9Q5C9 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nolc1E9Q5C9 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nolc1E9Q5C9 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nolc1E9Q5C9 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nolc1E9Q5C9 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nolc1E9Q5C9 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nolc1E9Q5C9 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nolc1E9Q5C9 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nolc1E9Q5C9 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nolc1E9Q5C9 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nolc1E9Q5C9 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nolc1E9Q5C9 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nolc1E9Q5C9 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nolc1E9Q5C9 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nolc1E9Q5C9 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nolc1E9Q5C9 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nolc1E9Q5C9 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nolc1E9Q5C9 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nolc1E9Q5C9 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Nolc1E9Q5C9 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nolc1E9Q5C9 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nolc1E9Q5C9 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nolc1E9Q5C9 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nolc1E9Q5C9 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nolc1E9Q5C9 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nolc1E9Q5C9 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nolc1E9Q5C9 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nolc1E9Q5C9 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nolc1E9Q5C9 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nolc1E9Q5C9 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nolc1E9Q5C9 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nolc1E9Q5C9 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Nolc1E9Q5C9 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nolc1E9Q5C9 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nolc1E9Q5C9 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nolc1E9Q5C9 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nolc1E9Q5C9 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nolc1E9Q5C9 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms