Protein–RNA interactions for Protein: E9Q557

Dsp, Desmoplakin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DspE9Q557 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DspE9Q557 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DspE9Q557 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
DspE9Q557 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DspE9Q557 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DspE9Q557 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DspE9Q557 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DspE9Q557 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DspE9Q557 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DspE9Q557 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DspE9Q557 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DspE9Q557 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DspE9Q557 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
DspE9Q557 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
DspE9Q557 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
DspE9Q557 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DspE9Q557 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
DspE9Q557 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DspE9Q557 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DspE9Q557 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DspE9Q557 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DspE9Q557 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DspE9Q557 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DspE9Q557 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DspE9Q557 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DspE9Q557 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DspE9Q557 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DspE9Q557 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DspE9Q557 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DspE9Q557 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DspE9Q557 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DspE9Q557 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DspE9Q557 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DspE9Q557 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DspE9Q557 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DspE9Q557 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DspE9Q557 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
DspE9Q557 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DspE9Q557 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DspE9Q557 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DspE9Q557 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DspE9Q557 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DspE9Q557 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DspE9Q557 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DspE9Q557 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DspE9Q557 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
DspE9Q557 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DspE9Q557 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
DspE9Q557 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DspE9Q557 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DspE9Q557 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DspE9Q557 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DspE9Q557 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DspE9Q557 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
DspE9Q557 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DspE9Q557 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DspE9Q557 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DspE9Q557 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DspE9Q557 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DspE9Q557 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DspE9Q557 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DspE9Q557 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DspE9Q557 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DspE9Q557 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DspE9Q557 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DspE9Q557 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DspE9Q557 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DspE9Q557 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DspE9Q557 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DspE9Q557 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DspE9Q557 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
DspE9Q557 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DspE9Q557 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DspE9Q557 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DspE9Q557 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DspE9Q557 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
DspE9Q557 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DspE9Q557 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DspE9Q557 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DspE9Q557 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DspE9Q557 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DspE9Q557 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DspE9Q557 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DspE9Q557 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DspE9Q557 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DspE9Q557 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DspE9Q557 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DspE9Q557 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DspE9Q557 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DspE9Q557 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DspE9Q557 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DspE9Q557 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DspE9Q557 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DspE9Q557 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DspE9Q557 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DspE9Q557 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DspE9Q557 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DspE9Q557 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DspE9Q557 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DspE9Q557 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms