Protein–RNA interactions for Protein: E9Q512

Trip11, Thyroid hormone receptor interactor 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip11E9Q512 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trip11E9Q512 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Trip11E9Q512 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trip11E9Q512 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trip11E9Q512 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trip11E9Q512 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trip11E9Q512 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Trip11E9Q512 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trip11E9Q512 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trip11E9Q512 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trip11E9Q512 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trip11E9Q512 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trip11E9Q512 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trip11E9Q512 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Trip11E9Q512 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trip11E9Q512 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trip11E9Q512 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trip11E9Q512 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trip11E9Q512 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trip11E9Q512 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trip11E9Q512 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trip11E9Q512 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trip11E9Q512 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trip11E9Q512 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trip11E9Q512 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trip11E9Q512 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trip11E9Q512 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trip11E9Q512 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trip11E9Q512 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trip11E9Q512 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trip11E9Q512 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trip11E9Q512 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trip11E9Q512 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trip11E9Q512 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trip11E9Q512 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trip11E9Q512 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trip11E9Q512 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Trip11E9Q512 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trip11E9Q512 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trip11E9Q512 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trip11E9Q512 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trip11E9Q512 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trip11E9Q512 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trip11E9Q512 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trip11E9Q512 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trip11E9Q512 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trip11E9Q512 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trip11E9Q512 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trip11E9Q512 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trip11E9Q512 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trip11E9Q512 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trip11E9Q512 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trip11E9Q512 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trip11E9Q512 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trip11E9Q512 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trip11E9Q512 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trip11E9Q512 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trip11E9Q512 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trip11E9Q512 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trip11E9Q512 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trip11E9Q512 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trip11E9Q512 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Trip11E9Q512 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trip11E9Q512 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trip11E9Q512 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trip11E9Q512 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trip11E9Q512 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Trip11E9Q512 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trip11E9Q512 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trip11E9Q512 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trip11E9Q512 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trip11E9Q512 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trip11E9Q512 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trip11E9Q512 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trip11E9Q512 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trip11E9Q512 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trip11E9Q512 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trip11E9Q512 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Trip11E9Q512 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trip11E9Q512 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trip11E9Q512 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trip11E9Q512 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trip11E9Q512 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trip11E9Q512 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trip11E9Q512 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trip11E9Q512 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trip11E9Q512 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trip11E9Q512 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trip11E9Q512 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trip11E9Q512 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trip11E9Q512 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trip11E9Q512 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Trip11E9Q512 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trip11E9Q512 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trip11E9Q512 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trip11E9Q512 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trip11E9Q512 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trip11E9Q512 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trip11E9Q512 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trip11E9Q512 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms