Protein–RNA interactions for Protein: E9Q328

5430401F13Rik, RIKEN cDNA 5430401F13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5430401F13RikE9Q328 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
5430401F13RikE9Q328 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
5430401F13RikE9Q328 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
5430401F13RikE9Q328 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
5430401F13RikE9Q328 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
5430401F13RikE9Q328 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
5430401F13RikE9Q328 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
5430401F13RikE9Q328 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
5430401F13RikE9Q328 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
5430401F13RikE9Q328 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
5430401F13RikE9Q328 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
5430401F13RikE9Q328 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
5430401F13RikE9Q328 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
5430401F13RikE9Q328 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
5430401F13RikE9Q328 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
5430401F13RikE9Q328 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
5430401F13RikE9Q328 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
5430401F13RikE9Q328 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
5430401F13RikE9Q328 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
5430401F13RikE9Q328 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
5430401F13RikE9Q328 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
5430401F13RikE9Q328 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
5430401F13RikE9Q328 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
5430401F13RikE9Q328 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
5430401F13RikE9Q328 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
5430401F13RikE9Q328 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
5430401F13RikE9Q328 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
5430401F13RikE9Q328 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
5430401F13RikE9Q328 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
5430401F13RikE9Q328 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
5430401F13RikE9Q328 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
5430401F13RikE9Q328 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
5430401F13RikE9Q328 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
5430401F13RikE9Q328 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
5430401F13RikE9Q328 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
5430401F13RikE9Q328 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
5430401F13RikE9Q328 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
5430401F13RikE9Q328 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
5430401F13RikE9Q328 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
5430401F13RikE9Q328 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
5430401F13RikE9Q328 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
5430401F13RikE9Q328 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
5430401F13RikE9Q328 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
5430401F13RikE9Q328 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
5430401F13RikE9Q328 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
5430401F13RikE9Q328 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
5430401F13RikE9Q328 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
5430401F13RikE9Q328 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
5430401F13RikE9Q328 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
5430401F13RikE9Q328 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
5430401F13RikE9Q328 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
5430401F13RikE9Q328 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
5430401F13RikE9Q328 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
5430401F13RikE9Q328 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
5430401F13RikE9Q328 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
5430401F13RikE9Q328 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
5430401F13RikE9Q328 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
5430401F13RikE9Q328 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
5430401F13RikE9Q328 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
5430401F13RikE9Q328 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
5430401F13RikE9Q328 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
5430401F13RikE9Q328 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
5430401F13RikE9Q328 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
5430401F13RikE9Q328 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
5430401F13RikE9Q328 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
5430401F13RikE9Q328 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
5430401F13RikE9Q328 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
5430401F13RikE9Q328 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
5430401F13RikE9Q328 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
5430401F13RikE9Q328 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
5430401F13RikE9Q328 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
5430401F13RikE9Q328 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
5430401F13RikE9Q328 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
5430401F13RikE9Q328 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
5430401F13RikE9Q328 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
5430401F13RikE9Q328 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
5430401F13RikE9Q328 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
5430401F13RikE9Q328 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
5430401F13RikE9Q328 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
5430401F13RikE9Q328 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
5430401F13RikE9Q328 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
5430401F13RikE9Q328 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
5430401F13RikE9Q328 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
5430401F13RikE9Q328 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
5430401F13RikE9Q328 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
5430401F13RikE9Q328 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
5430401F13RikE9Q328 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
5430401F13RikE9Q328 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
5430401F13RikE9Q328 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
5430401F13RikE9Q328 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
5430401F13RikE9Q328 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
5430401F13RikE9Q328 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
5430401F13RikE9Q328 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
5430401F13RikE9Q328 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
5430401F13RikE9Q328 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
5430401F13RikE9Q328 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
5430401F13RikE9Q328 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
5430401F13RikE9Q328 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
5430401F13RikE9Q328 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
5430401F13RikE9Q328 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms