Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zfp558E9Q1J0 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zfp558E9Q1J0 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zfp558E9Q1J0 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zfp558E9Q1J0 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zfp558E9Q1J0 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zfp558E9Q1J0 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zfp558E9Q1J0 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Zfp558E9Q1J0 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zfp558E9Q1J0 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zfp558E9Q1J0 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zfp558E9Q1J0 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zfp558E9Q1J0 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zfp558E9Q1J0 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zfp558E9Q1J0 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zfp558E9Q1J0 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zfp558E9Q1J0 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zfp558E9Q1J0 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zfp558E9Q1J0 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zfp558E9Q1J0 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zfp558E9Q1J0 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zfp558E9Q1J0 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zfp558E9Q1J0 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zfp558E9Q1J0 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zfp558E9Q1J0 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zfp558E9Q1J0 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zfp558E9Q1J0 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zfp558E9Q1J0 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zfp558E9Q1J0 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zfp558E9Q1J0 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zfp558E9Q1J0 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zfp558E9Q1J0 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zfp558E9Q1J0 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zfp558E9Q1J0 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zfp558E9Q1J0 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zfp558E9Q1J0 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zfp558E9Q1J0 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zfp558E9Q1J0 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zfp558E9Q1J0 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zfp558E9Q1J0 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zfp558E9Q1J0 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zfp558E9Q1J0 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zfp558E9Q1J0 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zfp558E9Q1J0 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zfp558E9Q1J0 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zfp558E9Q1J0 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zfp558E9Q1J0 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zfp558E9Q1J0 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zfp558E9Q1J0 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zfp558E9Q1J0 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zfp558E9Q1J0 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zfp558E9Q1J0 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zfp558E9Q1J0 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zfp558E9Q1J0 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Zfp558E9Q1J0 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zfp558E9Q1J0 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zfp558E9Q1J0 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zfp558E9Q1J0 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zfp558E9Q1J0 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zfp558E9Q1J0 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zfp558E9Q1J0 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zfp558E9Q1J0 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zfp558E9Q1J0 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zfp558E9Q1J0 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zfp558E9Q1J0 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zfp558E9Q1J0 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zfp558E9Q1J0 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Zfp558E9Q1J0 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zfp558E9Q1J0 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zfp558E9Q1J0 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zfp558E9Q1J0 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zfp558E9Q1J0 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zfp558E9Q1J0 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zfp558E9Q1J0 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zfp558E9Q1J0 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zfp558E9Q1J0 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zfp558E9Q1J0 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zfp558E9Q1J0 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zfp558E9Q1J0 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zfp558E9Q1J0 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zfp558E9Q1J0 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zfp558E9Q1J0 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zfp558E9Q1J0 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zfp558E9Q1J0 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zfp558E9Q1J0 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Zfp558E9Q1J0 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zfp558E9Q1J0 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zfp558E9Q1J0 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zfp558E9Q1J0 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zfp558E9Q1J0 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zfp558E9Q1J0 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zfp558E9Q1J0 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zfp558E9Q1J0 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zfp558E9Q1J0 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zfp558E9Q1J0 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zfp558E9Q1J0 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zfp558E9Q1J0 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zfp558E9Q1J0 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zfp558E9Q1J0 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zfp558E9Q1J0 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms