Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0V3

Vmn1r68, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r68E9Q0V3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r68E9Q0V3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r68E9Q0V3 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r68E9Q0V3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r68E9Q0V3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vmn1r68E9Q0V3 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r68E9Q0V3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r68E9Q0V3 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r68E9Q0V3 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r68E9Q0V3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r68E9Q0V3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r68E9Q0V3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r68E9Q0V3 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r68E9Q0V3 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r68E9Q0V3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r68E9Q0V3 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r68E9Q0V3 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r68E9Q0V3 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r68E9Q0V3 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r68E9Q0V3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r68E9Q0V3 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r68E9Q0V3 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r68E9Q0V3 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r68E9Q0V3 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r68E9Q0V3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r68E9Q0V3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r68E9Q0V3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r68E9Q0V3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r68E9Q0V3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r68E9Q0V3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r68E9Q0V3 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r68E9Q0V3 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r68E9Q0V3 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r68E9Q0V3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r68E9Q0V3 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r68E9Q0V3 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r68E9Q0V3 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r68E9Q0V3 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r68E9Q0V3 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r68E9Q0V3 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r68E9Q0V3 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r68E9Q0V3 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r68E9Q0V3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r68E9Q0V3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r68E9Q0V3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r68E9Q0V3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r68E9Q0V3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r68E9Q0V3 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r68E9Q0V3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r68E9Q0V3 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r68E9Q0V3 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r68E9Q0V3 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r68E9Q0V3 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r68E9Q0V3 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r68E9Q0V3 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r68E9Q0V3 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r68E9Q0V3 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r68E9Q0V3 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r68E9Q0V3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r68E9Q0V3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r68E9Q0V3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r68E9Q0V3 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r68E9Q0V3 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r68E9Q0V3 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r68E9Q0V3 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r68E9Q0V3 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r68E9Q0V3 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r68E9Q0V3 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r68E9Q0V3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms