Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0Q3

2610021A01Rik, RIKEN cDNA 2610021A01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610021A01RikE9Q0Q3 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
2610021A01RikE9Q0Q3 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
2610021A01RikE9Q0Q3 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
2610021A01RikE9Q0Q3 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
2610021A01RikE9Q0Q3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
2610021A01RikE9Q0Q3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
2610021A01RikE9Q0Q3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
2610021A01RikE9Q0Q3 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
2610021A01RikE9Q0Q3 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
2610021A01RikE9Q0Q3 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
2610021A01RikE9Q0Q3 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
2610021A01RikE9Q0Q3 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
2610021A01RikE9Q0Q3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
2610021A01RikE9Q0Q3 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
2610021A01RikE9Q0Q3 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
2610021A01RikE9Q0Q3 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
2610021A01RikE9Q0Q3 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
2610021A01RikE9Q0Q3 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
2610021A01RikE9Q0Q3 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
2610021A01RikE9Q0Q3 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
2610021A01RikE9Q0Q3 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
2610021A01RikE9Q0Q3 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
2610021A01RikE9Q0Q3 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
2610021A01RikE9Q0Q3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
2610021A01RikE9Q0Q3 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
2610021A01RikE9Q0Q3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
2610021A01RikE9Q0Q3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
2610021A01RikE9Q0Q3 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
2610021A01RikE9Q0Q3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
2610021A01RikE9Q0Q3 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
2610021A01RikE9Q0Q3 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
2610021A01RikE9Q0Q3 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
2610021A01RikE9Q0Q3 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
2610021A01RikE9Q0Q3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
2610021A01RikE9Q0Q3 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
2610021A01RikE9Q0Q3 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
2610021A01RikE9Q0Q3 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
2610021A01RikE9Q0Q3 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
2610021A01RikE9Q0Q3 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
2610021A01RikE9Q0Q3 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
2610021A01RikE9Q0Q3 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
2610021A01RikE9Q0Q3 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
2610021A01RikE9Q0Q3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
2610021A01RikE9Q0Q3 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
2610021A01RikE9Q0Q3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
2610021A01RikE9Q0Q3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
2610021A01RikE9Q0Q3 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
2610021A01RikE9Q0Q3 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
2610021A01RikE9Q0Q3 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
2610021A01RikE9Q0Q3 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
2610021A01RikE9Q0Q3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
2610021A01RikE9Q0Q3 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
2610021A01RikE9Q0Q3 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
2610021A01RikE9Q0Q3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
2610021A01RikE9Q0Q3 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
2610021A01RikE9Q0Q3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
2610021A01RikE9Q0Q3 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
2610021A01RikE9Q0Q3 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
2610021A01RikE9Q0Q3 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
2610021A01RikE9Q0Q3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
2610021A01RikE9Q0Q3 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
2610021A01RikE9Q0Q3 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
2610021A01RikE9Q0Q3 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
2610021A01RikE9Q0Q3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
2610021A01RikE9Q0Q3 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
2610021A01RikE9Q0Q3 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
2610021A01RikE9Q0Q3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
2610021A01RikE9Q0Q3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
2610021A01RikE9Q0Q3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
2610021A01RikE9Q0Q3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
2610021A01RikE9Q0Q3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
2610021A01RikE9Q0Q3 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
2610021A01RikE9Q0Q3 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
2610021A01RikE9Q0Q3 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
2610021A01RikE9Q0Q3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
2610021A01RikE9Q0Q3 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
2610021A01RikE9Q0Q3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
2610021A01RikE9Q0Q3 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
2610021A01RikE9Q0Q3 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
2610021A01RikE9Q0Q3 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
2610021A01RikE9Q0Q3 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
2610021A01RikE9Q0Q3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
2610021A01RikE9Q0Q3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
2610021A01RikE9Q0Q3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
2610021A01RikE9Q0Q3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
2610021A01RikE9Q0Q3 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
2610021A01RikE9Q0Q3 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
2610021A01RikE9Q0Q3 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
2610021A01RikE9Q0Q3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
2610021A01RikE9Q0Q3 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
2610021A01RikE9Q0Q3 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
2610021A01RikE9Q0Q3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
2610021A01RikE9Q0Q3 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms