Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM7

Scaf11, SR-related CTD-associated factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf11E9PZM7 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Scaf11E9PZM7 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Scaf11E9PZM7 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Scaf11E9PZM7 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Scaf11E9PZM7 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Scaf11E9PZM7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Scaf11E9PZM7 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Scaf11E9PZM7 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Scaf11E9PZM7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Scaf11E9PZM7 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Scaf11E9PZM7 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Scaf11E9PZM7 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Scaf11E9PZM7 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Scaf11E9PZM7 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Scaf11E9PZM7 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Scaf11E9PZM7 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Scaf11E9PZM7 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Scaf11E9PZM7 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Scaf11E9PZM7 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Scaf11E9PZM7 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Scaf11E9PZM7 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Scaf11E9PZM7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Scaf11E9PZM7 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Scaf11E9PZM7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Scaf11E9PZM7 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Scaf11E9PZM7 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Scaf11E9PZM7 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Scaf11E9PZM7 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Scaf11E9PZM7 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Scaf11E9PZM7 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Scaf11E9PZM7 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Scaf11E9PZM7 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Scaf11E9PZM7 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Scaf11E9PZM7 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Scaf11E9PZM7 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Scaf11E9PZM7 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Scaf11E9PZM7 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Scaf11E9PZM7 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Scaf11E9PZM7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Scaf11E9PZM7 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Scaf11E9PZM7 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Scaf11E9PZM7 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Scaf11E9PZM7 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Scaf11E9PZM7 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Scaf11E9PZM7 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Scaf11E9PZM7 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Scaf11E9PZM7 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Scaf11E9PZM7 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Scaf11E9PZM7 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Scaf11E9PZM7 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Scaf11E9PZM7 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Scaf11E9PZM7 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Scaf11E9PZM7 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Scaf11E9PZM7 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Scaf11E9PZM7 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Scaf11E9PZM7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Scaf11E9PZM7 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Scaf11E9PZM7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Scaf11E9PZM7 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Scaf11E9PZM7 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Scaf11E9PZM7 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Scaf11E9PZM7 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Scaf11E9PZM7 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Scaf11E9PZM7 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Scaf11E9PZM7 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Scaf11E9PZM7 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Scaf11E9PZM7 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Scaf11E9PZM7 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Scaf11E9PZM7 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Scaf11E9PZM7 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Scaf11E9PZM7 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Scaf11E9PZM7 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Scaf11E9PZM7 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Scaf11E9PZM7 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Scaf11E9PZM7 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Scaf11E9PZM7 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Scaf11E9PZM7 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Scaf11E9PZM7 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Scaf11E9PZM7 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Scaf11E9PZM7 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Scaf11E9PZM7 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Scaf11E9PZM7 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Scaf11E9PZM7 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Scaf11E9PZM7 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Scaf11E9PZM7 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Scaf11E9PZM7 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Scaf11E9PZM7 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Scaf11E9PZM7 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Scaf11E9PZM7 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Scaf11E9PZM7 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Scaf11E9PZM7 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Scaf11E9PZM7 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Scaf11E9PZM7 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Scaf11E9PZM7 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Scaf11E9PZM7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Scaf11E9PZM7 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Scaf11E9PZM7 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Scaf11E9PZM7 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Scaf11E9PZM7 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Scaf11E9PZM7 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms