Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM4

Chd2, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd2E9PZM4 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Chd2E9PZM4 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Chd2E9PZM4 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Chd2E9PZM4 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Chd2E9PZM4 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Chd2E9PZM4 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Chd2E9PZM4 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Chd2E9PZM4 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Chd2E9PZM4 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Chd2E9PZM4 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Chd2E9PZM4 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Chd2E9PZM4 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Chd2E9PZM4 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Chd2E9PZM4 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Chd2E9PZM4 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Chd2E9PZM4 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Chd2E9PZM4 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chd2E9PZM4 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chd2E9PZM4 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chd2E9PZM4 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chd2E9PZM4 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chd2E9PZM4 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chd2E9PZM4 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chd2E9PZM4 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chd2E9PZM4 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chd2E9PZM4 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chd2E9PZM4 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chd2E9PZM4 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chd2E9PZM4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chd2E9PZM4 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chd2E9PZM4 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Chd2E9PZM4 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chd2E9PZM4 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Chd2E9PZM4 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Chd2E9PZM4 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Chd2E9PZM4 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Chd2E9PZM4 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Chd2E9PZM4 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Chd2E9PZM4 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Chd2E9PZM4 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Chd2E9PZM4 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Chd2E9PZM4 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Chd2E9PZM4 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Chd2E9PZM4 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Chd2E9PZM4 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Chd2E9PZM4 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chd2E9PZM4 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Chd2E9PZM4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chd2E9PZM4 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chd2E9PZM4 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chd2E9PZM4 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Chd2E9PZM4 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Chd2E9PZM4 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Chd2E9PZM4 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Chd2E9PZM4 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Chd2E9PZM4 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Chd2E9PZM4 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Chd2E9PZM4 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chd2E9PZM4 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chd2E9PZM4 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chd2E9PZM4 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chd2E9PZM4 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chd2E9PZM4 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chd2E9PZM4 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chd2E9PZM4 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Chd2E9PZM4 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chd2E9PZM4 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chd2E9PZM4 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chd2E9PZM4 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chd2E9PZM4 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chd2E9PZM4 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chd2E9PZM4 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chd2E9PZM4 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chd2E9PZM4 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chd2E9PZM4 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chd2E9PZM4 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chd2E9PZM4 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chd2E9PZM4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chd2E9PZM4 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chd2E9PZM4 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chd2E9PZM4 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chd2E9PZM4 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chd2E9PZM4 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chd2E9PZM4 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Chd2E9PZM4 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Chd2E9PZM4 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Chd2E9PZM4 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Chd2E9PZM4 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Chd2E9PZM4 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Chd2E9PZM4 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Chd2E9PZM4 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Chd2E9PZM4 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Chd2E9PZM4 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Chd2E9PZM4 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Chd2E9PZM4 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Chd2E9PZM4 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Chd2E9PZM4 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Chd2E9PZM4 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Chd2E9PZM4 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chd2E9PZM4 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms