Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Brd1E9PZ26 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Brd1E9PZ26 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Brd1E9PZ26 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Brd1E9PZ26 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Brd1E9PZ26 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Brd1E9PZ26 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Brd1E9PZ26 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Brd1E9PZ26 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Brd1E9PZ26 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Brd1E9PZ26 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Brd1E9PZ26 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Brd1E9PZ26 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Brd1E9PZ26 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Brd1E9PZ26 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Brd1E9PZ26 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Brd1E9PZ26 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Brd1E9PZ26 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Brd1E9PZ26 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Brd1E9PZ26 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Brd1E9PZ26 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Brd1E9PZ26 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Brd1E9PZ26 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Brd1E9PZ26 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Brd1E9PZ26 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Brd1E9PZ26 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Brd1E9PZ26 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Brd1E9PZ26 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Brd1E9PZ26 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Brd1E9PZ26 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Brd1E9PZ26 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Brd1E9PZ26 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Brd1E9PZ26 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Brd1E9PZ26 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Brd1E9PZ26 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Brd1E9PZ26 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Brd1E9PZ26 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Brd1E9PZ26 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Brd1E9PZ26 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Brd1E9PZ26 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Brd1E9PZ26 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Brd1E9PZ26 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Brd1E9PZ26 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Brd1E9PZ26 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Brd1E9PZ26 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Brd1E9PZ26 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Brd1E9PZ26 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Brd1E9PZ26 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Brd1E9PZ26 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Brd1E9PZ26 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Brd1E9PZ26 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Brd1E9PZ26 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Brd1E9PZ26 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brd1E9PZ26 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brd1E9PZ26 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brd1E9PZ26 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brd1E9PZ26 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brd1E9PZ26 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brd1E9PZ26 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brd1E9PZ26 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brd1E9PZ26 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brd1E9PZ26 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brd1E9PZ26 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Brd1E9PZ26 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brd1E9PZ26 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brd1E9PZ26 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brd1E9PZ26 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brd1E9PZ26 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brd1E9PZ26 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brd1E9PZ26 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brd1E9PZ26 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brd1E9PZ26 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brd1E9PZ26 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brd1E9PZ26 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brd1E9PZ26 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brd1E9PZ26 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brd1E9PZ26 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brd1E9PZ26 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brd1E9PZ26 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brd1E9PZ26 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brd1E9PZ26 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Brd1E9PZ26 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brd1E9PZ26 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brd1E9PZ26 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brd1E9PZ26 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brd1E9PZ26 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brd1E9PZ26 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brd1E9PZ26 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brd1E9PZ26 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brd1E9PZ26 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brd1E9PZ26 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brd1E9PZ26 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brd1E9PZ26 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brd1E9PZ26 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brd1E9PZ26 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brd1E9PZ26 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Brd1E9PZ26 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brd1E9PZ26 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brd1E9PZ26 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brd1E9PZ26 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms