Protein–RNA interactions for Protein: E9PYK3

Parp4, Poly [ADP-ribose] polymerase, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp4E9PYK3 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Parp4E9PYK3 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Parp4E9PYK3 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Parp4E9PYK3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Parp4E9PYK3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Parp4E9PYK3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Parp4E9PYK3 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Parp4E9PYK3 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Parp4E9PYK3 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Parp4E9PYK3 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Parp4E9PYK3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Parp4E9PYK3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Parp4E9PYK3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Parp4E9PYK3 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Parp4E9PYK3 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Parp4E9PYK3 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Parp4E9PYK3 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Parp4E9PYK3 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Parp4E9PYK3 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Parp4E9PYK3 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Parp4E9PYK3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Parp4E9PYK3 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Parp4E9PYK3 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Parp4E9PYK3 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Parp4E9PYK3 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Parp4E9PYK3 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Parp4E9PYK3 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Parp4E9PYK3 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Parp4E9PYK3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Parp4E9PYK3 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Parp4E9PYK3 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Parp4E9PYK3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Parp4E9PYK3 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Parp4E9PYK3 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Parp4E9PYK3 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Parp4E9PYK3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Parp4E9PYK3 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Parp4E9PYK3 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Parp4E9PYK3 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Parp4E9PYK3 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Parp4E9PYK3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Parp4E9PYK3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Parp4E9PYK3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Parp4E9PYK3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Parp4E9PYK3 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Parp4E9PYK3 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Parp4E9PYK3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Parp4E9PYK3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Parp4E9PYK3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Parp4E9PYK3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Parp4E9PYK3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Parp4E9PYK3 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Parp4E9PYK3 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Parp4E9PYK3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Parp4E9PYK3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Parp4E9PYK3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Parp4E9PYK3 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Parp4E9PYK3 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Parp4E9PYK3 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Parp4E9PYK3 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Parp4E9PYK3 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Parp4E9PYK3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Parp4E9PYK3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Parp4E9PYK3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Parp4E9PYK3 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Parp4E9PYK3 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Parp4E9PYK3 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Parp4E9PYK3 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Parp4E9PYK3 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Parp4E9PYK3 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Parp4E9PYK3 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Parp4E9PYK3 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Parp4E9PYK3 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Parp4E9PYK3 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Parp4E9PYK3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Parp4E9PYK3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Parp4E9PYK3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Parp4E9PYK3 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Parp4E9PYK3 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Parp4E9PYK3 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Parp4E9PYK3 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Parp4E9PYK3 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Parp4E9PYK3 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Parp4E9PYK3 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Parp4E9PYK3 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Parp4E9PYK3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Parp4E9PYK3 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Parp4E9PYK3 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Parp4E9PYK3 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Parp4E9PYK3 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Parp4E9PYK3 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Parp4E9PYK3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Parp4E9PYK3 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Parp4E9PYK3 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Parp4E9PYK3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Parp4E9PYK3 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Parp4E9PYK3 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Parp4E9PYK3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Parp4E9PYK3 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Parp4E9PYK3 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms