Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Srp54bE9PXC0 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Srp54bE9PXC0 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Srp54bE9PXC0 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Srp54bE9PXC0 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Srp54bE9PXC0 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Srp54bE9PXC0 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Srp54bE9PXC0 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Srp54bE9PXC0 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Srp54bE9PXC0 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Srp54bE9PXC0 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Srp54bE9PXC0 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Srp54bE9PXC0 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Srp54bE9PXC0 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Srp54bE9PXC0 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Srp54bE9PXC0 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Srp54bE9PXC0 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Srp54bE9PXC0 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Srp54bE9PXC0 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Srp54bE9PXC0 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Srp54bE9PXC0 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Srp54bE9PXC0 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Srp54bE9PXC0 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Srp54bE9PXC0 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Srp54bE9PXC0 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Srp54bE9PXC0 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Srp54bE9PXC0 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Srp54bE9PXC0 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Srp54bE9PXC0 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Srp54bE9PXC0 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Srp54bE9PXC0 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Srp54bE9PXC0 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Srp54bE9PXC0 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Srp54bE9PXC0 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Srp54bE9PXC0 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Srp54bE9PXC0 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Srp54bE9PXC0 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Srp54bE9PXC0 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Srp54bE9PXC0 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Srp54bE9PXC0 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Srp54bE9PXC0 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Srp54bE9PXC0 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Srp54bE9PXC0 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Srp54bE9PXC0 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Srp54bE9PXC0 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Srp54bE9PXC0 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Srp54bE9PXC0 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Srp54bE9PXC0 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Srp54bE9PXC0 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Srp54bE9PXC0 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Srp54bE9PXC0 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Srp54bE9PXC0 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Srp54bE9PXC0 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Srp54bE9PXC0 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Srp54bE9PXC0 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Srp54bE9PXC0 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Srp54bE9PXC0 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Srp54bE9PXC0 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Srp54bE9PXC0 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Srp54bE9PXC0 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Srp54bE9PXC0 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Srp54bE9PXC0 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Srp54bE9PXC0 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Srp54bE9PXC0 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Srp54bE9PXC0 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Srp54bE9PXC0 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Srp54bE9PXC0 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Srp54bE9PXC0 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Srp54bE9PXC0 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Srp54bE9PXC0 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Srp54bE9PXC0 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Srp54bE9PXC0 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Srp54bE9PXC0 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Srp54bE9PXC0 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Srp54bE9PXC0 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Srp54bE9PXC0 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Srp54bE9PXC0 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Srp54bE9PXC0 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Srp54bE9PXC0 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Srp54bE9PXC0 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Srp54bE9PXC0 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Srp54bE9PXC0 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Srp54bE9PXC0 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Srp54bE9PXC0 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Srp54bE9PXC0 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Srp54bE9PXC0 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Srp54bE9PXC0 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Srp54bE9PXC0 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Srp54bE9PXC0 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Srp54bE9PXC0 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Srp54bE9PXC0 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Srp54bE9PXC0 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Srp54bE9PXC0 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Srp54bE9PXC0 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Srp54bE9PXC0 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Srp54bE9PXC0 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Srp54bE9PXC0 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Srp54bE9PXC0 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Srp54bE9PXC0 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Srp54bE9PXC0 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms