Protein–RNA interactions for Protein: E9PWW9

Rsf1, Remodeling and spacing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsf1E9PWW9 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Rsf1E9PWW9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Rsf1E9PWW9 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Rsf1E9PWW9 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Rsf1E9PWW9 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Rsf1E9PWW9 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Rsf1E9PWW9 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Rsf1E9PWW9 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Rsf1E9PWW9 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Rsf1E9PWW9 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Rsf1E9PWW9 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Rsf1E9PWW9 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Rsf1E9PWW9 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Rsf1E9PWW9 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Rsf1E9PWW9 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Rsf1E9PWW9 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Rsf1E9PWW9 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Rsf1E9PWW9 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Rsf1E9PWW9 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Rsf1E9PWW9 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Rsf1E9PWW9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Rsf1E9PWW9 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Rsf1E9PWW9 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Rsf1E9PWW9 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Rsf1E9PWW9 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Rsf1E9PWW9 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Rsf1E9PWW9 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Rsf1E9PWW9 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Rsf1E9PWW9 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Rsf1E9PWW9 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Rsf1E9PWW9 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Rsf1E9PWW9 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Rsf1E9PWW9 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Rsf1E9PWW9 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Rsf1E9PWW9 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Rsf1E9PWW9 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Rsf1E9PWW9 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Rsf1E9PWW9 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Rsf1E9PWW9 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Rsf1E9PWW9 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Rsf1E9PWW9 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Rsf1E9PWW9 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Rsf1E9PWW9 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Rsf1E9PWW9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Rsf1E9PWW9 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Rsf1E9PWW9 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Rsf1E9PWW9 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Rsf1E9PWW9 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Rsf1E9PWW9 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Rsf1E9PWW9 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Rsf1E9PWW9 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Rsf1E9PWW9 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Rsf1E9PWW9 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Rsf1E9PWW9 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Rsf1E9PWW9 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Rsf1E9PWW9 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Rsf1E9PWW9 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Rsf1E9PWW9 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Rsf1E9PWW9 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Rsf1E9PWW9 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Rsf1E9PWW9 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Rsf1E9PWW9 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Rsf1E9PWW9 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Rsf1E9PWW9 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Rsf1E9PWW9 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Rsf1E9PWW9 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Rsf1E9PWW9 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Rsf1E9PWW9 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Rsf1E9PWW9 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Rsf1E9PWW9 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Rsf1E9PWW9 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
Rsf1E9PWW9 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Rsf1E9PWW9 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
Rsf1E9PWW9 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Rsf1E9PWW9 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Rsf1E9PWW9 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Rsf1E9PWW9 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Rsf1E9PWW9 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Rsf1E9PWW9 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Rsf1E9PWW9 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Rsf1E9PWW9 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Rsf1E9PWW9 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Rsf1E9PWW9 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Rsf1E9PWW9 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Rsf1E9PWW9 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Rsf1E9PWW9 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Rsf1E9PWW9 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Rsf1E9PWW9 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Rsf1E9PWW9 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Rsf1E9PWW9 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Rsf1E9PWW9 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Rsf1E9PWW9 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Rsf1E9PWW9 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Rsf1E9PWW9 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Rsf1E9PWW9 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Rsf1E9PWW9 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Rsf1E9PWW9 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Rsf1E9PWW9 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Rsf1E9PWW9 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Rsf1E9PWW9 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms