Protein–RNA interactions for Protein: E9PWP9

4931408C20Rik, RIKEN cDNA 4931408C20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931408C20RikE9PWP9 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
4931408C20RikE9PWP9 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
4931408C20RikE9PWP9 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
4931408C20RikE9PWP9 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
4931408C20RikE9PWP9 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
4931408C20RikE9PWP9 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
4931408C20RikE9PWP9 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
4931408C20RikE9PWP9 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
4931408C20RikE9PWP9 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
4931408C20RikE9PWP9 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
4931408C20RikE9PWP9 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
4931408C20RikE9PWP9 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
4931408C20RikE9PWP9 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
4931408C20RikE9PWP9 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
4931408C20RikE9PWP9 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
4931408C20RikE9PWP9 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
4931408C20RikE9PWP9 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
4931408C20RikE9PWP9 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
4931408C20RikE9PWP9 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
4931408C20RikE9PWP9 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
4931408C20RikE9PWP9 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
4931408C20RikE9PWP9 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
4931408C20RikE9PWP9 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
4931408C20RikE9PWP9 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
4931408C20RikE9PWP9 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
4931408C20RikE9PWP9 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
4931408C20RikE9PWP9 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
4931408C20RikE9PWP9 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
4931408C20RikE9PWP9 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
4931408C20RikE9PWP9 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
4931408C20RikE9PWP9 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
4931408C20RikE9PWP9 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
4931408C20RikE9PWP9 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
4931408C20RikE9PWP9 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
4931408C20RikE9PWP9 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
4931408C20RikE9PWP9 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
4931408C20RikE9PWP9 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
4931408C20RikE9PWP9 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
4931408C20RikE9PWP9 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
4931408C20RikE9PWP9 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
4931408C20RikE9PWP9 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
4931408C20RikE9PWP9 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
4931408C20RikE9PWP9 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
4931408C20RikE9PWP9 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
4931408C20RikE9PWP9 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
4931408C20RikE9PWP9 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
4931408C20RikE9PWP9 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
4931408C20RikE9PWP9 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
4931408C20RikE9PWP9 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
4931408C20RikE9PWP9 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
4931408C20RikE9PWP9 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
4931408C20RikE9PWP9 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
4931408C20RikE9PWP9 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
4931408C20RikE9PWP9 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
4931408C20RikE9PWP9 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
4931408C20RikE9PWP9 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
4931408C20RikE9PWP9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
4931408C20RikE9PWP9 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
4931408C20RikE9PWP9 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
4931408C20RikE9PWP9 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
4931408C20RikE9PWP9 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
4931408C20RikE9PWP9 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
4931408C20RikE9PWP9 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
4931408C20RikE9PWP9 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
4931408C20RikE9PWP9 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
4931408C20RikE9PWP9 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
4931408C20RikE9PWP9 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
4931408C20RikE9PWP9 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
4931408C20RikE9PWP9 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
4931408C20RikE9PWP9 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
4931408C20RikE9PWP9 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
4931408C20RikE9PWP9 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
4931408C20RikE9PWP9 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
4931408C20RikE9PWP9 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
4931408C20RikE9PWP9 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
4931408C20RikE9PWP9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
4931408C20RikE9PWP9 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
4931408C20RikE9PWP9 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
4931408C20RikE9PWP9 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
4931408C20RikE9PWP9 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
4931408C20RikE9PWP9 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
4931408C20RikE9PWP9 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
4931408C20RikE9PWP9 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
4931408C20RikE9PWP9 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
4931408C20RikE9PWP9 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
4931408C20RikE9PWP9 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
4931408C20RikE9PWP9 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
4931408C20RikE9PWP9 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
4931408C20RikE9PWP9 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
4931408C20RikE9PWP9 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
4931408C20RikE9PWP9 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
4931408C20RikE9PWP9 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
4931408C20RikE9PWP9 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
4931408C20RikE9PWP9 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
4931408C20RikE9PWP9 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
4931408C20RikE9PWP9 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
4931408C20RikE9PWP9 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
4931408C20RikE9PWP9 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
4931408C20RikE9PWP9 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
4931408C20RikE9PWP9 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms