Protein–RNA interactions for Protein: E9PVZ3

Ccdc144b, Coiled-coil domain-containing 144B, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc144bE9PVZ3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc144bE9PVZ3 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc144bE9PVZ3 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc144bE9PVZ3 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc144bE9PVZ3 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc144bE9PVZ3 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc144bE9PVZ3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc144bE9PVZ3 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc144bE9PVZ3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc144bE9PVZ3 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc144bE9PVZ3 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc144bE9PVZ3 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc144bE9PVZ3 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc144bE9PVZ3 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc144bE9PVZ3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc144bE9PVZ3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc144bE9PVZ3 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc144bE9PVZ3 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc144bE9PVZ3 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc144bE9PVZ3 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc144bE9PVZ3 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc144bE9PVZ3 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc144bE9PVZ3 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc144bE9PVZ3 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc144bE9PVZ3 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc144bE9PVZ3 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc144bE9PVZ3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc144bE9PVZ3 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc144bE9PVZ3 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc144bE9PVZ3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc144bE9PVZ3 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc144bE9PVZ3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc144bE9PVZ3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc144bE9PVZ3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc144bE9PVZ3 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc144bE9PVZ3 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc144bE9PVZ3 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc144bE9PVZ3 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc144bE9PVZ3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc144bE9PVZ3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc144bE9PVZ3 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc144bE9PVZ3 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc144bE9PVZ3 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc144bE9PVZ3 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc144bE9PVZ3 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc144bE9PVZ3 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc144bE9PVZ3 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc144bE9PVZ3 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc144bE9PVZ3 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc144bE9PVZ3 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc144bE9PVZ3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc144bE9PVZ3 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc144bE9PVZ3 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc144bE9PVZ3 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc144bE9PVZ3 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc144bE9PVZ3 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc144bE9PVZ3 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc144bE9PVZ3 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc144bE9PVZ3 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc144bE9PVZ3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc144bE9PVZ3 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc144bE9PVZ3 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc144bE9PVZ3 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc144bE9PVZ3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc144bE9PVZ3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc144bE9PVZ3 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc144bE9PVZ3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc144bE9PVZ3 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc144bE9PVZ3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc144bE9PVZ3 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc144bE9PVZ3 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc144bE9PVZ3 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc144bE9PVZ3 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc144bE9PVZ3 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc144bE9PVZ3 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc144bE9PVZ3 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc144bE9PVZ3 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc144bE9PVZ3 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc144bE9PVZ3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc144bE9PVZ3 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc144bE9PVZ3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc144bE9PVZ3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc144bE9PVZ3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc144bE9PVZ3 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc144bE9PVZ3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc144bE9PVZ3 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc144bE9PVZ3 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc144bE9PVZ3 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc144bE9PVZ3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc144bE9PVZ3 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc144bE9PVZ3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc144bE9PVZ3 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc144bE9PVZ3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc144bE9PVZ3 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc144bE9PVZ3 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms