Protein–RNA interactions for Protein: E9PVD1

Ccdc62, Coiled-coil domain-containing protein 62, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc62E9PVD1 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc62E9PVD1 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc62E9PVD1 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc62E9PVD1 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc62E9PVD1 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc62E9PVD1 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc62E9PVD1 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc62E9PVD1 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc62E9PVD1 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc62E9PVD1 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc62E9PVD1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc62E9PVD1 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc62E9PVD1 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc62E9PVD1 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc62E9PVD1 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc62E9PVD1 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc62E9PVD1 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc62E9PVD1 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc62E9PVD1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc62E9PVD1 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc62E9PVD1 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc62E9PVD1 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc62E9PVD1 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc62E9PVD1 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc62E9PVD1 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc62E9PVD1 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc62E9PVD1 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc62E9PVD1 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc62E9PVD1 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc62E9PVD1 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc62E9PVD1 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc62E9PVD1 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc62E9PVD1 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc62E9PVD1 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc62E9PVD1 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc62E9PVD1 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc62E9PVD1 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc62E9PVD1 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc62E9PVD1 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc62E9PVD1 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc62E9PVD1 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc62E9PVD1 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc62E9PVD1 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc62E9PVD1 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc62E9PVD1 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc62E9PVD1 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc62E9PVD1 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc62E9PVD1 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc62E9PVD1 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc62E9PVD1 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc62E9PVD1 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc62E9PVD1 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc62E9PVD1 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc62E9PVD1 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc62E9PVD1 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc62E9PVD1 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc62E9PVD1 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc62E9PVD1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc62E9PVD1 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc62E9PVD1 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc62E9PVD1 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc62E9PVD1 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc62E9PVD1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc62E9PVD1 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc62E9PVD1 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc62E9PVD1 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc62E9PVD1 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc62E9PVD1 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc62E9PVD1 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc62E9PVD1 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc62E9PVD1 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc62E9PVD1 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc62E9PVD1 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc62E9PVD1 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc62E9PVD1 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc62E9PVD1 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc62E9PVD1 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc62E9PVD1 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc62E9PVD1 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc62E9PVD1 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc62E9PVD1 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc62E9PVD1 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc62E9PVD1 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc62E9PVD1 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc62E9PVD1 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc62E9PVD1 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc62E9PVD1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc62E9PVD1 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc62E9PVD1 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc62E9PVD1 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc62E9PVD1 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc62E9PVD1 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc62E9PVD1 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc62E9PVD1 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc62E9PVD1 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc62E9PVD1 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc62E9PVD1 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc62E9PVD1 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc62E9PVD1 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc62E9PVD1 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms