Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc175E9PVB3 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc175E9PVB3 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc175E9PVB3 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc175E9PVB3 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc175E9PVB3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc175E9PVB3 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc175E9PVB3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc175E9PVB3 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc175E9PVB3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc175E9PVB3 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc175E9PVB3 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc175E9PVB3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc175E9PVB3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc175E9PVB3 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc175E9PVB3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc175E9PVB3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc175E9PVB3 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc175E9PVB3 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc175E9PVB3 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc175E9PVB3 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc175E9PVB3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc175E9PVB3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc175E9PVB3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc175E9PVB3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc175E9PVB3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc175E9PVB3 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc175E9PVB3 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc175E9PVB3 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc175E9PVB3 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc175E9PVB3 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc175E9PVB3 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc175E9PVB3 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc175E9PVB3 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc175E9PVB3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc175E9PVB3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc175E9PVB3 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc175E9PVB3 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc175E9PVB3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc175E9PVB3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc175E9PVB3 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc175E9PVB3 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc175E9PVB3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc175E9PVB3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc175E9PVB3 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc175E9PVB3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc175E9PVB3 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc175E9PVB3 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc175E9PVB3 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc175E9PVB3 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc175E9PVB3 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc175E9PVB3 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc175E9PVB3 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc175E9PVB3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc175E9PVB3 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc175E9PVB3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc175E9PVB3 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc175E9PVB3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc175E9PVB3 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc175E9PVB3 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc175E9PVB3 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc175E9PVB3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc175E9PVB3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc175E9PVB3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc175E9PVB3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc175E9PVB3 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc175E9PVB3 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc175E9PVB3 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc175E9PVB3 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc175E9PVB3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc175E9PVB3 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc175E9PVB3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc175E9PVB3 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc175E9PVB3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc175E9PVB3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc175E9PVB3 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc175E9PVB3 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc175E9PVB3 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc175E9PVB3 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc175E9PVB3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc175E9PVB3 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc175E9PVB3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc175E9PVB3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc175E9PVB3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc175E9PVB3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc175E9PVB3 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc175E9PVB3 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc175E9PVB3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc175E9PVB3 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc175E9PVB3 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc175E9PVB3 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc175E9PVB3 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc175E9PVB3 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc175E9PVB3 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc175E9PVB3 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc175E9PVB3 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc175E9PVB3 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc175E9PVB3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc175E9PVB3 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc175E9PVB3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms