Protein–RNA interactions for Protein: E9PVA8

Gcn1, eIF-2-alpha kinase activator GCN1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcn1E9PVA8 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gcn1E9PVA8 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gcn1E9PVA8 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gcn1E9PVA8 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gcn1E9PVA8 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gcn1E9PVA8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gcn1E9PVA8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gcn1E9PVA8 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gcn1E9PVA8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gcn1E9PVA8 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gcn1E9PVA8 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gcn1E9PVA8 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gcn1E9PVA8 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gcn1E9PVA8 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gcn1E9PVA8 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gcn1E9PVA8 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gcn1E9PVA8 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gcn1E9PVA8 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gcn1E9PVA8 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gcn1E9PVA8 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gcn1E9PVA8 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gcn1E9PVA8 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gcn1E9PVA8 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gcn1E9PVA8 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gcn1E9PVA8 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gcn1E9PVA8 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gcn1E9PVA8 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gcn1E9PVA8 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gcn1E9PVA8 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gcn1E9PVA8 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gcn1E9PVA8 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gcn1E9PVA8 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gcn1E9PVA8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gcn1E9PVA8 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gcn1E9PVA8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gcn1E9PVA8 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gcn1E9PVA8 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gcn1E9PVA8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gcn1E9PVA8 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gcn1E9PVA8 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gcn1E9PVA8 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gcn1E9PVA8 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gcn1E9PVA8 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gcn1E9PVA8 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gcn1E9PVA8 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gcn1E9PVA8 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gcn1E9PVA8 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gcn1E9PVA8 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gcn1E9PVA8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gcn1E9PVA8 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gcn1E9PVA8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gcn1E9PVA8 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gcn1E9PVA8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gcn1E9PVA8 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gcn1E9PVA8 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gcn1E9PVA8 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gcn1E9PVA8 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gcn1E9PVA8 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gcn1E9PVA8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gcn1E9PVA8 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gcn1E9PVA8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gcn1E9PVA8 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gcn1E9PVA8 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gcn1E9PVA8 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Gcn1E9PVA8 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gcn1E9PVA8 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gcn1E9PVA8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gcn1E9PVA8 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gcn1E9PVA8 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gcn1E9PVA8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gcn1E9PVA8 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gcn1E9PVA8 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gcn1E9PVA8 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gcn1E9PVA8 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gcn1E9PVA8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Gcn1E9PVA8 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gcn1E9PVA8 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gcn1E9PVA8 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gcn1E9PVA8 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gcn1E9PVA8 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gcn1E9PVA8 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gcn1E9PVA8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gcn1E9PVA8 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gcn1E9PVA8 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gcn1E9PVA8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gcn1E9PVA8 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gcn1E9PVA8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gcn1E9PVA8 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gcn1E9PVA8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gcn1E9PVA8 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gcn1E9PVA8 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gcn1E9PVA8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gcn1E9PVA8 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gcn1E9PVA8 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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