Protein–RNA interactions for Protein: E9PV24

Fga, Fibrinogen alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgaE9PV24 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FgaE9PV24 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FgaE9PV24 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FgaE9PV24 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FgaE9PV24 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FgaE9PV24 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FgaE9PV24 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FgaE9PV24 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FgaE9PV24 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FgaE9PV24 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
FgaE9PV24 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FgaE9PV24 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
FgaE9PV24 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FgaE9PV24 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FgaE9PV24 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FgaE9PV24 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FgaE9PV24 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FgaE9PV24 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FgaE9PV24 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
FgaE9PV24 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
FgaE9PV24 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FgaE9PV24 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FgaE9PV24 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FgaE9PV24 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FgaE9PV24 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FgaE9PV24 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FgaE9PV24 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FgaE9PV24 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FgaE9PV24 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FgaE9PV24 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FgaE9PV24 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FgaE9PV24 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FgaE9PV24 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FgaE9PV24 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FgaE9PV24 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FgaE9PV24 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FgaE9PV24 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FgaE9PV24 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FgaE9PV24 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FgaE9PV24 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
FgaE9PV24 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FgaE9PV24 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FgaE9PV24 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FgaE9PV24 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FgaE9PV24 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FgaE9PV24 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FgaE9PV24 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FgaE9PV24 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FgaE9PV24 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FgaE9PV24 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FgaE9PV24 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FgaE9PV24 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FgaE9PV24 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FgaE9PV24 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FgaE9PV24 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FgaE9PV24 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FgaE9PV24 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FgaE9PV24 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FgaE9PV24 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FgaE9PV24 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FgaE9PV24 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
FgaE9PV24 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FgaE9PV24 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FgaE9PV24 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FgaE9PV24 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FgaE9PV24 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FgaE9PV24 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FgaE9PV24 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FgaE9PV24 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FgaE9PV24 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FgaE9PV24 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FgaE9PV24 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FgaE9PV24 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FgaE9PV24 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FgaE9PV24 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FgaE9PV24 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FgaE9PV24 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FgaE9PV24 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FgaE9PV24 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
FgaE9PV24 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FgaE9PV24 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FgaE9PV24 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FgaE9PV24 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FgaE9PV24 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FgaE9PV24 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FgaE9PV24 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FgaE9PV24 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FgaE9PV24 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FgaE9PV24 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FgaE9PV24 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FgaE9PV24 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FgaE9PV24 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FgaE9PV24 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FgaE9PV24 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FgaE9PV24 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FgaE9PV24 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FgaE9PV24 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FgaE9PV24 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FgaE9PV24 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FgaE9PV24 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms