Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Syde2E9PUP1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Syde2E9PUP1 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Syde2E9PUP1 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Syde2E9PUP1 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Syde2E9PUP1 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Syde2E9PUP1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Syde2E9PUP1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Syde2E9PUP1 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Syde2E9PUP1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Syde2E9PUP1 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Syde2E9PUP1 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Syde2E9PUP1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Syde2E9PUP1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Syde2E9PUP1 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Syde2E9PUP1 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Syde2E9PUP1 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Syde2E9PUP1 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Syde2E9PUP1 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Syde2E9PUP1 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Syde2E9PUP1 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Syde2E9PUP1 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Syde2E9PUP1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Syde2E9PUP1 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Syde2E9PUP1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Syde2E9PUP1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Syde2E9PUP1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Syde2E9PUP1 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Syde2E9PUP1 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Syde2E9PUP1 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Syde2E9PUP1 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Syde2E9PUP1 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Syde2E9PUP1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Syde2E9PUP1 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Syde2E9PUP1 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Syde2E9PUP1 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Syde2E9PUP1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Syde2E9PUP1 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Syde2E9PUP1 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Syde2E9PUP1 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Syde2E9PUP1 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Syde2E9PUP1 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Syde2E9PUP1 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Syde2E9PUP1 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Syde2E9PUP1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Syde2E9PUP1 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Syde2E9PUP1 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Syde2E9PUP1 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Syde2E9PUP1 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Syde2E9PUP1 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Syde2E9PUP1 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Syde2E9PUP1 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Syde2E9PUP1 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Syde2E9PUP1 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Syde2E9PUP1 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Syde2E9PUP1 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Syde2E9PUP1 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Syde2E9PUP1 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Syde2E9PUP1 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Syde2E9PUP1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Syde2E9PUP1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Syde2E9PUP1 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Syde2E9PUP1 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Syde2E9PUP1 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Syde2E9PUP1 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Syde2E9PUP1 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Syde2E9PUP1 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Syde2E9PUP1 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Syde2E9PUP1 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Syde2E9PUP1 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Syde2E9PUP1 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Syde2E9PUP1 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Syde2E9PUP1 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Syde2E9PUP1 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Syde2E9PUP1 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Syde2E9PUP1 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Syde2E9PUP1 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Syde2E9PUP1 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Syde2E9PUP1 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Syde2E9PUP1 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Syde2E9PUP1 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Syde2E9PUP1 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Syde2E9PUP1 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Syde2E9PUP1 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Syde2E9PUP1 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Syde2E9PUP1 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Syde2E9PUP1 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Syde2E9PUP1 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Syde2E9PUP1 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Syde2E9PUP1 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Syde2E9PUP1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Syde2E9PUP1 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Syde2E9PUP1 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Syde2E9PUP1 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Syde2E9PUP1 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Syde2E9PUP1 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Syde2E9PUP1 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Syde2E9PUP1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Syde2E9PUP1 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Syde2E9PUP1 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms