Protein–RNA interactions for Protein: E9PUD6

Zscan18, Zinc finger and SCAN domain-containing 18, mousemouse

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan18E9PUD6 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Zscan18E9PUD6 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Zscan18E9PUD6 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Zscan18E9PUD6 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Zscan18E9PUD6 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Zscan18E9PUD6 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Zscan18E9PUD6 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Zscan18E9PUD6 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Zscan18E9PUD6 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Zscan18E9PUD6 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Zscan18E9PUD6 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Zscan18E9PUD6 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Zscan18E9PUD6 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Zscan18E9PUD6 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Zscan18E9PUD6 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Zscan18E9PUD6 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Zscan18E9PUD6 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Zscan18E9PUD6 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Zscan18E9PUD6 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Zscan18E9PUD6 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Zscan18E9PUD6 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Zscan18E9PUD6 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Zscan18E9PUD6 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Zscan18E9PUD6 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Zscan18E9PUD6 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Zscan18E9PUD6 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Zscan18E9PUD6 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Zscan18E9PUD6 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Zscan18E9PUD6 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Zscan18E9PUD6 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Zscan18E9PUD6 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zscan18E9PUD6 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Zscan18E9PUD6 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zscan18E9PUD6 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zscan18E9PUD6 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Zscan18E9PUD6 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zscan18E9PUD6 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zscan18E9PUD6 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zscan18E9PUD6 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zscan18E9PUD6 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zscan18E9PUD6 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zscan18E9PUD6 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zscan18E9PUD6 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zscan18E9PUD6 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zscan18E9PUD6 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zscan18E9PUD6 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Zscan18E9PUD6 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zscan18E9PUD6 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zscan18E9PUD6 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zscan18E9PUD6 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zscan18E9PUD6 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zscan18E9PUD6 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zscan18E9PUD6 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zscan18E9PUD6 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zscan18E9PUD6 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zscan18E9PUD6 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zscan18E9PUD6 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zscan18E9PUD6 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zscan18E9PUD6 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zscan18E9PUD6 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zscan18E9PUD6 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zscan18E9PUD6 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Zscan18E9PUD6 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zscan18E9PUD6 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Zscan18E9PUD6 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Zscan18E9PUD6 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zscan18E9PUD6 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zscan18E9PUD6 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zscan18E9PUD6 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zscan18E9PUD6 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zscan18E9PUD6 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Zscan18E9PUD6 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zscan18E9PUD6 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zscan18E9PUD6 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zscan18E9PUD6 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zscan18E9PUD6 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zscan18E9PUD6 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zscan18E9PUD6 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zscan18E9PUD6 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zscan18E9PUD6 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Zscan18E9PUD6 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zscan18E9PUD6 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zscan18E9PUD6 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zscan18E9PUD6 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zscan18E9PUD6 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zscan18E9PUD6 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zscan18E9PUD6 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zscan18E9PUD6 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zscan18E9PUD6 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zscan18E9PUD6 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zscan18E9PUD6 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zscan18E9PUD6 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zscan18E9PUD6 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zscan18E9PUD6 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zscan18E9PUD6 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zscan18E9PUD6 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zscan18E9PUD6 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zscan18E9PUD6 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zscan18E9PUD6 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zscan18E9PUD6 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms