Protein–RNA interactions for Protein: E1U8D0

Soga1, Protein SOGA1, mousemouse

Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga1E1U8D0 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Soga1E1U8D0 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Soga1E1U8D0 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Soga1E1U8D0 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Soga1E1U8D0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Soga1E1U8D0 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Soga1E1U8D0 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Soga1E1U8D0 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Soga1E1U8D0 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Soga1E1U8D0 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Soga1E1U8D0 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Soga1E1U8D0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Soga1E1U8D0 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Soga1E1U8D0 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Soga1E1U8D0 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Soga1E1U8D0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Soga1E1U8D0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Soga1E1U8D0 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Soga1E1U8D0 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Soga1E1U8D0 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Soga1E1U8D0 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Soga1E1U8D0 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Soga1E1U8D0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Soga1E1U8D0 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Soga1E1U8D0 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Soga1E1U8D0 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Soga1E1U8D0 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Soga1E1U8D0 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Soga1E1U8D0 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Soga1E1U8D0 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Soga1E1U8D0 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Soga1E1U8D0 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Soga1E1U8D0 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Soga1E1U8D0 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Soga1E1U8D0 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Soga1E1U8D0 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Soga1E1U8D0 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Soga1E1U8D0 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Soga1E1U8D0 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Soga1E1U8D0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Soga1E1U8D0 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Soga1E1U8D0 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Soga1E1U8D0 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Soga1E1U8D0 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Soga1E1U8D0 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Soga1E1U8D0 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Soga1E1U8D0 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Soga1E1U8D0 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Soga1E1U8D0 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Soga1E1U8D0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Soga1E1U8D0 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Soga1E1U8D0 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Soga1E1U8D0 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Soga1E1U8D0 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Soga1E1U8D0 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Soga1E1U8D0 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Soga1E1U8D0 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Soga1E1U8D0 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Soga1E1U8D0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Soga1E1U8D0 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Soga1E1U8D0 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Soga1E1U8D0 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Soga1E1U8D0 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Soga1E1U8D0 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Soga1E1U8D0 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Soga1E1U8D0 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Soga1E1U8D0 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Soga1E1U8D0 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Soga1E1U8D0 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Soga1E1U8D0 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Soga1E1U8D0 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Soga1E1U8D0 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Soga1E1U8D0 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Soga1E1U8D0 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Soga1E1U8D0 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Soga1E1U8D0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Soga1E1U8D0 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Soga1E1U8D0 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Soga1E1U8D0 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Soga1E1U8D0 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Soga1E1U8D0 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Soga1E1U8D0 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Soga1E1U8D0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Soga1E1U8D0 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Soga1E1U8D0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Soga1E1U8D0 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Soga1E1U8D0 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Soga1E1U8D0 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Soga1E1U8D0 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Soga1E1U8D0 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Soga1E1U8D0 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Soga1E1U8D0 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Soga1E1U8D0 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Soga1E1U8D0 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Soga1E1U8D0 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Soga1E1U8D0 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Soga1E1U8D0 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Soga1E1U8D0 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Soga1E1U8D0 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Soga1E1U8D0 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms