Protein–RNA interactions for Protein: E0CXF8

BC035044, cDNA sequence BC035044, mousemouse

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC035044E0CXF8 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BC035044E0CXF8 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
BC035044E0CXF8 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BC035044E0CXF8 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BC035044E0CXF8 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BC035044E0CXF8 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BC035044E0CXF8 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
BC035044E0CXF8 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BC035044E0CXF8 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BC035044E0CXF8 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BC035044E0CXF8 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BC035044E0CXF8 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BC035044E0CXF8 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BC035044E0CXF8 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BC035044E0CXF8 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BC035044E0CXF8 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BC035044E0CXF8 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BC035044E0CXF8 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BC035044E0CXF8 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
BC035044E0CXF8 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BC035044E0CXF8 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BC035044E0CXF8 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BC035044E0CXF8 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BC035044E0CXF8 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BC035044E0CXF8 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BC035044E0CXF8 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BC035044E0CXF8 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BC035044E0CXF8 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BC035044E0CXF8 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BC035044E0CXF8 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BC035044E0CXF8 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BC035044E0CXF8 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
BC035044E0CXF8 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BC035044E0CXF8 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BC035044E0CXF8 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BC035044E0CXF8 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BC035044E0CXF8 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BC035044E0CXF8 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BC035044E0CXF8 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BC035044E0CXF8 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BC035044E0CXF8 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BC035044E0CXF8 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BC035044E0CXF8 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BC035044E0CXF8 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BC035044E0CXF8 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
BC035044E0CXF8 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BC035044E0CXF8 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BC035044E0CXF8 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BC035044E0CXF8 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
BC035044E0CXF8 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BC035044E0CXF8 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BC035044E0CXF8 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BC035044E0CXF8 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BC035044E0CXF8 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BC035044E0CXF8 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BC035044E0CXF8 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BC035044E0CXF8 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BC035044E0CXF8 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BC035044E0CXF8 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
BC035044E0CXF8 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
BC035044E0CXF8 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
BC035044E0CXF8 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BC035044E0CXF8 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BC035044E0CXF8 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
BC035044E0CXF8 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BC035044E0CXF8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BC035044E0CXF8 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BC035044E0CXF8 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BC035044E0CXF8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BC035044E0CXF8 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BC035044E0CXF8 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BC035044E0CXF8 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BC035044E0CXF8 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BC035044E0CXF8 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BC035044E0CXF8 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
BC035044E0CXF8 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BC035044E0CXF8 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BC035044E0CXF8 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BC035044E0CXF8 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BC035044E0CXF8 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BC035044E0CXF8 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BC035044E0CXF8 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BC035044E0CXF8 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BC035044E0CXF8 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BC035044E0CXF8 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BC035044E0CXF8 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BC035044E0CXF8 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BC035044E0CXF8 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
BC035044E0CXF8 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BC035044E0CXF8 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BC035044E0CXF8 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BC035044E0CXF8 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
BC035044E0CXF8 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BC035044E0CXF8 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BC035044E0CXF8 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BC035044E0CXF8 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BC035044E0CXF8 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BC035044E0CXF8 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
BC035044E0CXF8 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BC035044E0CXF8 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms