Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Vpreb3D3Z6J4 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms