Protein–RNA interactions for Protein: D3Z622

4930455H04Rik, MCG1045678, mousemouse

Predictions only

Length 58 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930455H04RikD3Z622 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930455H04RikD3Z622 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930455H04RikD3Z622 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930455H04RikD3Z622 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930455H04RikD3Z622 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930455H04RikD3Z622 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930455H04RikD3Z622 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930455H04RikD3Z622 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930455H04RikD3Z622 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930455H04RikD3Z622 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930455H04RikD3Z622 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930455H04RikD3Z622 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930455H04RikD3Z622 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930455H04RikD3Z622 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930455H04RikD3Z622 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930455H04RikD3Z622 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930455H04RikD3Z622 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930455H04RikD3Z622 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930455H04RikD3Z622 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930455H04RikD3Z622 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930455H04RikD3Z622 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930455H04RikD3Z622 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930455H04RikD3Z622 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
4930455H04RikD3Z622 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930455H04RikD3Z622 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930455H04RikD3Z622 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930455H04RikD3Z622 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930455H04RikD3Z622 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930455H04RikD3Z622 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930455H04RikD3Z622 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930455H04RikD3Z622 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930455H04RikD3Z622 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930455H04RikD3Z622 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930455H04RikD3Z622 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930455H04RikD3Z622 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930455H04RikD3Z622 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930455H04RikD3Z622 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930455H04RikD3Z622 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930455H04RikD3Z622 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930455H04RikD3Z622 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930455H04RikD3Z622 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930455H04RikD3Z622 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930455H04RikD3Z622 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930455H04RikD3Z622 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930455H04RikD3Z622 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930455H04RikD3Z622 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930455H04RikD3Z622 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930455H04RikD3Z622 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930455H04RikD3Z622 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
4930455H04RikD3Z622 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930455H04RikD3Z622 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930455H04RikD3Z622 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930455H04RikD3Z622 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930455H04RikD3Z622 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930455H04RikD3Z622 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930455H04RikD3Z622 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930455H04RikD3Z622 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930455H04RikD3Z622 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930455H04RikD3Z622 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930455H04RikD3Z622 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
4930455H04RikD3Z622 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930455H04RikD3Z622 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930455H04RikD3Z622 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930455H04RikD3Z622 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
4930455H04RikD3Z622 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
4930455H04RikD3Z622 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930455H04RikD3Z622 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930455H04RikD3Z622 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930455H04RikD3Z622 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930455H04RikD3Z622 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930455H04RikD3Z622 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930455H04RikD3Z622 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930455H04RikD3Z622 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930455H04RikD3Z622 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930455H04RikD3Z622 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930455H04RikD3Z622 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930455H04RikD3Z622 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930455H04RikD3Z622 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930455H04RikD3Z622 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
4930455H04RikD3Z622 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930455H04RikD3Z622 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930455H04RikD3Z622 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930455H04RikD3Z622 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930455H04RikD3Z622 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930455H04RikD3Z622 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930455H04RikD3Z622 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930455H04RikD3Z622 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930455H04RikD3Z622 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930455H04RikD3Z622 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930455H04RikD3Z622 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930455H04RikD3Z622 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930455H04RikD3Z622 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930455H04RikD3Z622 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930455H04RikD3Z622 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930455H04RikD3Z622 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930455H04RikD3Z622 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930455H04RikD3Z622 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930455H04RikD3Z622 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930455H04RikD3Z622 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
4930455H04RikD3Z622 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms