Protein–RNA interactions for Protein: D3Z4S3

Ptrhd1, Putative peptidyl-tRNA hydrolase PTRHD1, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptrhd1D3Z4S3 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptrhd1D3Z4S3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptrhd1D3Z4S3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptrhd1D3Z4S3 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptrhd1D3Z4S3 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptrhd1D3Z4S3 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptrhd1D3Z4S3 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptrhd1D3Z4S3 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptrhd1D3Z4S3 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptrhd1D3Z4S3 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptrhd1D3Z4S3 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptrhd1D3Z4S3 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptrhd1D3Z4S3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptrhd1D3Z4S3 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptrhd1D3Z4S3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptrhd1D3Z4S3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptrhd1D3Z4S3 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ptrhd1D3Z4S3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptrhd1D3Z4S3 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptrhd1D3Z4S3 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptrhd1D3Z4S3 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptrhd1D3Z4S3 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptrhd1D3Z4S3 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptrhd1D3Z4S3 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptrhd1D3Z4S3 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptrhd1D3Z4S3 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptrhd1D3Z4S3 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptrhd1D3Z4S3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptrhd1D3Z4S3 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptrhd1D3Z4S3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptrhd1D3Z4S3 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptrhd1D3Z4S3 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptrhd1D3Z4S3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptrhd1D3Z4S3 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptrhd1D3Z4S3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptrhd1D3Z4S3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptrhd1D3Z4S3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptrhd1D3Z4S3 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptrhd1D3Z4S3 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptrhd1D3Z4S3 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptrhd1D3Z4S3 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptrhd1D3Z4S3 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptrhd1D3Z4S3 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptrhd1D3Z4S3 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptrhd1D3Z4S3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptrhd1D3Z4S3 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptrhd1D3Z4S3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptrhd1D3Z4S3 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptrhd1D3Z4S3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptrhd1D3Z4S3 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptrhd1D3Z4S3 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptrhd1D3Z4S3 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptrhd1D3Z4S3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptrhd1D3Z4S3 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptrhd1D3Z4S3 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptrhd1D3Z4S3 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ptrhd1D3Z4S3 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ptrhd1D3Z4S3 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ptrhd1D3Z4S3 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ptrhd1D3Z4S3 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ptrhd1D3Z4S3 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ptrhd1D3Z4S3 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptrhd1D3Z4S3 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptrhd1D3Z4S3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptrhd1D3Z4S3 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptrhd1D3Z4S3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptrhd1D3Z4S3 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptrhd1D3Z4S3 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptrhd1D3Z4S3 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptrhd1D3Z4S3 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptrhd1D3Z4S3 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptrhd1D3Z4S3 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptrhd1D3Z4S3 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptrhd1D3Z4S3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptrhd1D3Z4S3 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptrhd1D3Z4S3 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptrhd1D3Z4S3 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptrhd1D3Z4S3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptrhd1D3Z4S3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptrhd1D3Z4S3 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptrhd1D3Z4S3 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptrhd1D3Z4S3 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptrhd1D3Z4S3 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptrhd1D3Z4S3 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptrhd1D3Z4S3 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptrhd1D3Z4S3 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptrhd1D3Z4S3 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptrhd1D3Z4S3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptrhd1D3Z4S3 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptrhd1D3Z4S3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptrhd1D3Z4S3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptrhd1D3Z4S3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptrhd1D3Z4S3 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptrhd1D3Z4S3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptrhd1D3Z4S3 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptrhd1D3Z4S3 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptrhd1D3Z4S3 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptrhd1D3Z4S3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptrhd1D3Z4S3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ptrhd1D3Z4S3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms