Protein–RNA interactions for Protein: D3YZV8

Ccdc8, Coiled-coil domain-containing protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc8D3YZV8 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc8D3YZV8 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc8D3YZV8 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc8D3YZV8 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc8D3YZV8 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc8D3YZV8 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc8D3YZV8 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc8D3YZV8 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc8D3YZV8 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc8D3YZV8 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc8D3YZV8 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc8D3YZV8 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc8D3YZV8 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc8D3YZV8 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc8D3YZV8 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc8D3YZV8 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc8D3YZV8 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc8D3YZV8 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc8D3YZV8 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc8D3YZV8 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc8D3YZV8 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc8D3YZV8 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc8D3YZV8 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc8D3YZV8 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc8D3YZV8 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc8D3YZV8 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc8D3YZV8 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc8D3YZV8 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc8D3YZV8 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc8D3YZV8 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc8D3YZV8 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc8D3YZV8 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc8D3YZV8 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc8D3YZV8 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc8D3YZV8 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc8D3YZV8 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc8D3YZV8 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc8D3YZV8 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc8D3YZV8 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc8D3YZV8 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc8D3YZV8 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc8D3YZV8 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc8D3YZV8 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc8D3YZV8 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc8D3YZV8 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc8D3YZV8 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc8D3YZV8 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc8D3YZV8 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc8D3YZV8 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc8D3YZV8 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc8D3YZV8 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc8D3YZV8 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc8D3YZV8 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc8D3YZV8 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc8D3YZV8 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc8D3YZV8 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc8D3YZV8 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc8D3YZV8 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc8D3YZV8 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc8D3YZV8 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc8D3YZV8 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc8D3YZV8 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc8D3YZV8 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc8D3YZV8 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc8D3YZV8 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc8D3YZV8 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc8D3YZV8 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc8D3YZV8 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc8D3YZV8 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc8D3YZV8 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc8D3YZV8 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc8D3YZV8 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc8D3YZV8 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc8D3YZV8 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc8D3YZV8 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc8D3YZV8 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc8D3YZV8 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc8D3YZV8 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc8D3YZV8 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc8D3YZV8 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc8D3YZV8 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc8D3YZV8 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc8D3YZV8 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc8D3YZV8 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc8D3YZV8 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc8D3YZV8 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc8D3YZV8 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc8D3YZV8 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc8D3YZV8 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc8D3YZV8 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc8D3YZV8 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc8D3YZV8 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc8D3YZV8 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc8D3YZV8 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc8D3YZV8 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc8D3YZV8 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc8D3YZV8 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc8D3YZV8 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc8D3YZV8 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc8D3YZV8 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms