Protein–RNA interactions for Protein: D3YXS5

Kif28p, Kinesin-like protein KIF28P, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif28pD3YXS5 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Kif28pD3YXS5 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Kif28pD3YXS5 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Kif28pD3YXS5 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Kif28pD3YXS5 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Kif28pD3YXS5 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Kif28pD3YXS5 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Kif28pD3YXS5 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Kif28pD3YXS5 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Kif28pD3YXS5 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Kif28pD3YXS5 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Kif28pD3YXS5 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Kif28pD3YXS5 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Kif28pD3YXS5 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Kif28pD3YXS5 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Kif28pD3YXS5 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Kif28pD3YXS5 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Kif28pD3YXS5 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Kif28pD3YXS5 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kif28pD3YXS5 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kif28pD3YXS5 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kif28pD3YXS5 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kif28pD3YXS5 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kif28pD3YXS5 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kif28pD3YXS5 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kif28pD3YXS5 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kif28pD3YXS5 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kif28pD3YXS5 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kif28pD3YXS5 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Kif28pD3YXS5 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kif28pD3YXS5 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kif28pD3YXS5 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kif28pD3YXS5 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kif28pD3YXS5 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kif28pD3YXS5 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kif28pD3YXS5 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kif28pD3YXS5 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kif28pD3YXS5 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kif28pD3YXS5 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kif28pD3YXS5 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kif28pD3YXS5 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kif28pD3YXS5 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kif28pD3YXS5 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kif28pD3YXS5 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kif28pD3YXS5 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kif28pD3YXS5 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kif28pD3YXS5 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kif28pD3YXS5 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kif28pD3YXS5 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kif28pD3YXS5 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Kif28pD3YXS5 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kif28pD3YXS5 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kif28pD3YXS5 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kif28pD3YXS5 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kif28pD3YXS5 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kif28pD3YXS5 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kif28pD3YXS5 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kif28pD3YXS5 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kif28pD3YXS5 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kif28pD3YXS5 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kif28pD3YXS5 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kif28pD3YXS5 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kif28pD3YXS5 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kif28pD3YXS5 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kif28pD3YXS5 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kif28pD3YXS5 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kif28pD3YXS5 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kif28pD3YXS5 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kif28pD3YXS5 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Kif28pD3YXS5 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kif28pD3YXS5 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Kif28pD3YXS5 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kif28pD3YXS5 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kif28pD3YXS5 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kif28pD3YXS5 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kif28pD3YXS5 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kif28pD3YXS5 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kif28pD3YXS5 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kif28pD3YXS5 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kif28pD3YXS5 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kif28pD3YXS5 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kif28pD3YXS5 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kif28pD3YXS5 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kif28pD3YXS5 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kif28pD3YXS5 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kif28pD3YXS5 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kif28pD3YXS5 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kif28pD3YXS5 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kif28pD3YXS5 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kif28pD3YXS5 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kif28pD3YXS5 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kif28pD3YXS5 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kif28pD3YXS5 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kif28pD3YXS5 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kif28pD3YXS5 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kif28pD3YXS5 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Kif28pD3YXS5 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kif28pD3YXS5 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kif28pD3YXS5 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kif28pD3YXS5 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms